Pour ce genre de montage un soft multipiste serait plus adapté à mon avis. tu peux donc utiliser des "gros" soft et sequencer (Logic Audio, Cubase, Samplitude, etc..). il existe aussi une version de Cool Edit gérant le multipistes. Mais un des plus simples d'emploi serait ACID à mon avis.
Avec un multipiste tu n'auras qu'à placer ta première chanson sur une piste, la seconde sur la deuxième et à l'ajuster..