C'est simplement pour l'écoute ?
Si oui, utilise un player capable d'utiliser les fichiers .cue : foobar2000 nativement, et winamp avec un improbable plug-in.
Le fichier .cue doit se trouver dans le même répertoire et porter le même nom que le fichier .Ape qui lui correspond.
Parfois, il faut éditer le fichier .cue pour que cela fonctionne. Enlever la mention "WAVE" qui se trouve en tête de fichier (deuxième ou troisème ligne, dans ces eaux-là).
Enfin, si tu utilises foobar2000, tu peux essayer de coller les informations du .cue dans un champ nommé CUESHEET. Normallement, en chargeant ton gros fichier dans foobar2000, il fera automatiquement apparaitre des plages (virtuelles).
Une fois que tu es parvenu à ce résultat, tu peux si cela t'arrange découper le fichier en plusieurs grace au diskwriter, qui peut réencoder les fichiers (sans pertes si tu restes avec un format lossless). Mais la découpe de fichier sans réencodage n'est pas à ma connaissance chose possible.