Je ne pense pas qu'il y ait de fonction standard pour ça.
Va falloir ruser en ayant une anim principale qui appelle la première anim à l'intérieur d'un movie clip avec la fonction loadMovie, puis rebelote loadmovie de ta deuxième anim dans un autre movie clip et tu joues sur l'alpha entre les deux.
Sinon tu importes dans une anim vierge tes deux SWF sur des calques séparés et tu fais manuellement baisser l'alpha de l'une et monter l'alpha de l'autre.