Tout dépend de ce que tu veux faire...
En fait Winbindd est destiné à compléter le système d'authentification de Linux (fichier /etc/passwd pour les users, /etc/groups pour les groupes).
Ca permet à ton serveur linux de se connecter au controleur de domaine NT et d'authentifier l'utilisateur avec un compte NT.
Au login, ton user saisit domaine+nom_utilisateur et son mot de passe NT.
Par contre, il n'importe pas les utilisateurs et les groupes NT, donc si tu supprime ton controleur de domaine, ça ne marche plus.