pour nautilus je sais pas.
pour le term, soit tu fais un ALT+click droit sur le term indésirable et tu regarde ces paramètres Remember, sinon, sur le bureau, tu as accès via click-droit à un menu remember qui liste toutes les applis qui ont des propriétés mémorisées.
S'il apparaît pas dedans, fait un pstree pour voir qui est son père