D'après un test que j'ai lu, la grosse cartouche noire est une encre à base de pigments (+ de contraste pour le texte), la petite c'est de la 'teinture' (dye-based). En general, c'est pas recommandé de mélanger les deux types (dans une photo par exemple).
Maintenant, vu qu'à priori dans ton kit de recharge les encres sont du meme type, tu devrait pouvoir mettre le meme noir partout (sans garantie cependant).