Reporte toi à la section Drive Xpert de la doc de la mobo.
Pour ma part je n'ai pas essayé le mode auto, j'ai forcé 'enable' et passé le mode en 'normal' avant de pouvoir voir mes disques avec fdisk. Faut dire qu'au début j'avais branché mon disque sur le 2e port orange sans le savoir, et du coup il ne me voyait rien.
Du peu que j'ai compris, si t'active pas dans le BIOS il ne se passera rien de probant sur ton système. Après je ne suis pas sous Windows, je ne sais pas s'il y a d'autres différences.