J'ai la même chose. Par défaut, les disques inutilisés se mettent en veille après 20 minutes. Les HDD arrêtent leurs plateaux et parquent leurs têtes.
Le problème (c'en est pas vraiment un) vient au moment de les redémarrer, pour un ssd pas de problèmes vu que y'a rien de mécanique dedans. Par contre les HDD doivent redémarrer leurs plateaux et "déparquer les têtes de lecture" ce qui prend généralement entre 2 et 5 secondes.
Windows réveille les disques avant de s'éteindre pour mettre les derniers fichiers qui étaient en RAM, inscrire l'état des disques à l'arrêt, vérifier que la table des partitions est correct, etc.
Tu remarque aussi que quand tu essaie d'accéder à un HDD qui est en veille, ça prend 3-5 secondes et tu l'entend démarrer. Alors que si il était déjà démarré, c'est instantané.
La solution à ton "problème" serait de désactiver la mise en veille des disques (gestion de l'alimentation -> ton mode d'alimentation -> paramètres avancés -> mise en veille des disques (ou un truc du genre) -> mettre la valeur sur 0 je crois.)