salut orin,
ça m'est deja arrivé en réinstallant un systeme juste sur une partition d'un disque, en fait ça serait windows qui perd l'indexage des données.
Essaie de le brancher en secondaire sur autre pc pour moi ça a lancer au demarrage de l'ordi une recuperation des fichiers orphelins ou qqch comme ça, et après, magie, toutes mes données étaient de retour.
Sinon tu peux essayer des logiciels comme pc inspector file recovery ou get data back (for ntfs ou fat).
Voila en esperant que ça t'aide...