Non, fdisk /mbr, c'est une option "caché" de fdisk qui permet de réinitialiser le master boot record, il n'y a aucun risque pour les donnée.
Je ne dit pas que c'est la solution ultime, mais ca peut marcher. Sinon, essaye d'installer un partition magic et voir ce qui se passe avec, il y a certainement une fonctionnalité pour récupérer les partition "perdu".