Beacoup montent des configurations avec un disque dur dédié à windows, voir un disque dur plus rapide (1000 rpm) dédié au système, mais concrètement ca apporte quoi ?  
Y'a vraiment un gain sensible ou c'est juste quelques secondes de gagnées sur le lancement de gros logiciels ?

  10000 rpm c'est un retour en arriere de plusieurs annees  
 
Pour certaines applications, d'utiliser un disque physique different de celui des donnees pour le ou les disques de travail apporte un gain non negligeable.
Pour un 10000 rpm pour le systeme, ca apporte un confort supplementaire a defaut d'apporter un reel gain quantifiable. Personnellement, j'apprecie ce petit gain...
Deuxieme point, si besoin est, la reinstallation de l'OS est facilite, si les donnees sont sur un autre disque.

Effectivement    

 
Merci de ta réponse, je comprends mieux pourquoi certains font ca.