Il faut que le CPU soit bien PCI Express V3.0
Comme tu ne précises pas ta carte mère et ton CPU, difficile de savoir.
Si tu as par ex, un Intel de génération 2xxx Sandy Bridge (type i5 2500K), tu ne pourras pas avoir du PCI Express fonctionnant en V3.0, même si ta carte mère est compatible.
Car le contrôleur PCI Express est maintenant inclus dans le CPU.
En revanche, si tu as un CPU de génération Ivy Bridge (3xxx, comme i5 3470) ou Sandy Bridge E (comme I7 3820) et SI la carte mère est bien compatible PCI Express V 3.0, alors la, en effet, la carte vidéo peut fonctionner en V 3.0