Bah en fait Illustrator est dédié à la création d'images vecorielles, et InDesign à la mise en page... en vectoriel aussi donc. Ce dernier gère donc plus simplement le cadrage de tes docs importés.
Perso, je place Photoshop et Illustrator au même niveau, soit pour la création d'images (Bitmap/vectoriel) ; et InDesign ensuite, dans lequel j'importe mes différentes images pour les mettre en place au sein d'un document complet.
Du coup, si je veux pixelliser (TIFF,...) une image vectorielle (EPS, AI), je le fais sous photoshop qui est là pour ça. Après que ce soit un fichier EPS ou AI ne change rien entre Photoshop et Illustrator, c'est juste que d'une manière générale, je répugne à ouvrir le fichier natif d'un logiciel sur un autre...