salut, j'ai juste quelques quetions sur la transamination non enzymatique entre 3 acides amines differents + PLP donnant de l'aldimine
 
 
les 3 aa :  
norvaline (alpha aminovalerate)
d-AVA (delta aminovalerate)
ornithine (aplha, delata diaminovalerate)
 
j'ai plusieurs xp aboutissant au fait que l'ornithine a plus d'affinite avec le plp et forme plus rapidement de l'aldimine et ensuite de la cetimine en chauffant.
 
par contre ds l'enonce ils disent a un moment que le PLP reagit faiblement avec les alpha- et extremement faiblement voir absence de reaction avec les omega (aplha+delta)
 
ce detail mis a part mes 2 questions sont :  
pourquoi il est plus interessant de prendre des aa a 5 atomes de C ??
 
 
et aussi le role du nombre et de la place du NH2 ds l'aa
oblige ca va permettre une meilleur reaction mais exactement ca concerne quoi ? la place du NH2 par rapport au coo- qui risque de gener la reaction aa PLP ?
 
voila merci de m'eclairer

De la transamination non enzymatique...
mais avec un coenzyme?! C'est encore plus étonnant...
Wahwww...et par curiosité ça met combien de temps?
T'es chimiste?

Bon alors de ce que je vois là dedans en réfléchissant comme ça:
La réaction non-enzymatique c'est pas le top.
 
Je ne vois pas pourquoi tu poses la première question puisque tu n'as que des acides aminés à 5C?!
M'enfin si tu regardes le repliement possible de ta molécule en Fischer tu te rends compte que les deux amines peuvent venir à proximité l'une de l'autre, alors encombrement stérique où coactivateur de réaction j'en sais rien, mais ça doit jouer dans la réaction.
 
Pour la deuxième question:
L'amine en alpha est celle qui forme la base de schiff avec le pyridoxalphosphate lors de la réaction enzymatique c'est innérent au site actif.
Dans ce site actif le phosphate du PLP est en relation avec une fonction amine de l'apoenzyme pour rester dans la bonne position pour la réaction.
 
Pourquoi l'amine delta ne jouerait-elle pas un rôle dans la liaison au Phosphate pour facilité la réaction de transamination sur l'amine alpha? (Ce n'est qu'une hypothèse...)
Ce qui nous amènerait à répondre à la première question du même coup...
Tu m'achètes ça?
 
En plus ça expliquerait que l'ornithine réagisse mieux que les autres qui n'ont qu'une fonction amine.

ayeuh, ca pue la chimie orga ca

  ouai...

j'ai tjrs été une merde en orga. Ca me saoule comme pas possible les histoire de ptits n'atomes qui tirent sur leur pitits voisins

Chimie orga de lycée?
Il faut que ça soit bien expliqué, et surtout parler des application.
Sinon c'est super chiant.  
Et franchement je suis pas très bon...des fois y des trucs qui te semblent évident, et en fait c'est pas ça du tout?!

 
Pas vraiment non (en deug/licence de bioch)

Ah! Toi aussi t'es biochimiste...
C'est peut-être pour ça.
Les chimistes nous font de la chime au rabais!

 
Il parait

Je parle juste du "titre"...

yop suis en license de bioch    
mais bon c plus par conseil des prof que par amour, la bioch me gene pas mais mon kif c'est plus la bio
 
 
pour le tps de reaction bah ca dure ... longtps    mais bon c'est juste un tp donc on lance la manip et on s'en fout
 
 
pour le coup des aa a 5C c la question a la con du prof de tp qui posé au prof d'amphi m'as valu 10 min de reflexion de la part du prof avec posage de goute puis un "je sais pas dsl"    
 
 
 
en tt cas merci pour les reponses, vais cogiter tt ca    

Ben j'espère que c'est ça...
Mais les chimistes seraient plus fort là dessus.
Essaie de la poser dans le topic des chimistes!

Alors ça donne quoi?

 
Transaminatiooooon !  
 
 
 
 

Vendredÿ

C'est trollÿ...je sais... quand même!

bon on a rendu le bazard sans vraiment trouver d'explication
on a fait une pirouette en disant que ca jouait ds la cyclisation mais bon ...
reponse ds 2 semaines environ

Je pense pas que ça se cyclise à proprement parler, mais le repliement de la molécule fait certainement interagire le NH2 terminal avec le C alpha...