Folding@Home
 

 
 
 
Actualités du 3 avril 2020
 
Article sur les simulations menées sur F@H sur la protéine S du COVID-A9 Cette protéine a été baptisée Demogorgon car elle rappelle la gueule du monstre dans la série Stranger Things lorsqu'elle s'ouvre pour se lier au récepteur ACE-2. Les simulations cherchent à identifier des sites pouvant potentiellement être des cibles pour les anticorps ou des médicaments (clickable). Merci à ToTOW pour le lien.
 

 
 
 
 
Qu'est-ce que c'est?
 
La recherche médicale a besoin d'énormément de puissance de calcul notamment pour simuler de quelle manière les protéines se plient dans l'espace afin de déterminer leurs propriétés. Ces calculs se font habituellement sur des supercalculateurs, mais ces machines sont chères et souvent peu disponibles car en nombre limité.
 
L'université de Stanford a élaboré un outil alternatif : utiliser un grand nombre d'ordinateurs personnels connectés entre eux via Internet pour simuler comment se plient les protéines. C'est le projet Folding@Home.
 
 
 
 
Quel rapport avec le COVID-19?
 
Le projet Folding@Home alloue une part de ses ressources à la recherche sur le coronavirus.
Annonce officielle
 
Les simulations engagées autour du COVID-19 ont deux objectifs :
 
 
    - étudier comment le virus infecte les cellules cibles afin de comprendre l'épidémie et diminuer sa propagation,
    - déterminer des sites propices aux liens avec des anticorps afin d'optimiser le développement et l'efficacité du vaccin
 
Si vous voulez vous rendre utile par ces temps de confinement (et après), c'est probablement le meilleur moyen.
 
 
 
 
Quelle est la puissance de calcul? [MAJ]
 
La puissance de calcul de Folding@Home dépend du nombre d'ordinateurs participant au projet à un moment donné.
En mars avril 2020 sa puissance avoisine 473 PFLOPS 770 PFLOPS 1 EXAFLOPS (1 EXAFLOPS = 1000 PFLOPS = 1.000.000 TFLOPS =  10^15 FLOPS). A comparer le supercalculateur Summit d'IBM (en PLS) a une puissance de 200 PFLOPS
 
Article qui en parle
 
Top500 supercalculateurs
 

 
 
 
 
 
Comment participer?
 
Pour participer, il suffit de télécharger un logiciel qui tournera en fond sur votre ordinateur. Il mobilisera la puissance de calcul inexploitée de votre machine (CPU et GPU) pour les besoins du projet Folding@Home.
 
Pour télécharger c'est par là : télécharger le client
 
 
Configuration du client :
 
 
    - Username : nom d'utilisateur
    - Team Number (facultatif) : laisser vide ou entrer le numéro de la team que vous voulez rejoindre (par exemple si vous voulez rejoindre l'Alliance francophone, entrez le numéro 51)
    - Passkey : la passkey est facultative, mais son utilisation permet de bénéficier du bonus de points sur la rapidité de retour des résultats. Vous pouvez en générer une ici : Générer une passkey
          (les bonus sont accessibles après avoir fait 10 WU)
 
 
Si vous avez déjà participé par le passé, il est possible de reprendre où vous en étiez en utilisant le même Username. De même pour la passkey, utiliser la même combinaison Username/Email vous permettra de retrouver la votre.
 
 
 
400.000 nouveaux membres depuis l’annonce de sa participation à la lutte contre la pandémie de Covid-19
 
 
 
 
Folder en équipe
 

 
Vous pouvez folder seul ou bien rejoindre une équipe. L'alliance francophone est une équipe issue de la fusion d'un groupe hfr et d'un groupe québécois.
L'alliance a son site Alliance francophone et un Forum
 
 
 
 
FAQ
 
Pour les questions éventuelles : FAQ sur le site de l'alliance francophone
 
 
 

 
 
 
 
Liste des projets de recherche sur le COVID-19 MAJ du 05/04/2020
 
 
14300 series
 
    14328 - Coronavirus SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor N3 (PDBID: 6lu7)  
    14329 - Coronavirus SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor N3 (PDBID: 6lu7)  
    14332 - SARS coronavirus spike receptor-binding domain complexed with its receptor ACE2 (PDB: 2ajf)
    14333 - SARS-CoV-2 RBD domain in complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (PDBs: 6nb8, 2ghv) [http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.028]
    14334 - SARS-CoV-2 RBD domain in complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (PDBs: 6nb8, 2ghv) [http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.028]
    14335 - SARS-CoV-2 RBD domain in complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (PDBs: 6nb8, 2ghv) [http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.028]
    14336 -SARS-CoV-2 RBD domain in complex with human ACE2 receptor (PDB: 6vsb, 6acg)
    14337 - FEP screening of Coronavirus SARS-CoV-2 main protease in complex with potential inhibitors (100_Ligands)
    14338 - FEP screening of Coronavirus SARS-CoV-2 main protease in complex with potential inhibitors  (100_Ligands)
    14339 - FEP screening of potential protease inhibitors in solution  (100_Ligands)
    14340 - clone of 14332
    14341 - clone of 14333
    14342 - clone of 14334
    14343 - clone of 14335
    14344 - clone of 14336
    14345 - clone of 14338
    14346 - FEP screening of Coronavirus SARS-CoV-2 main protease in complex with potential inhibitors  (7 fragment hits)
    14347 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (7 fragment hits)
    14348 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (7 fragment hits)
    14349 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 1-100)
    14350 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 101-200)
    14351 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 201-300)
    14352 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 301-400)
    14353 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 401-500)
    14354 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 501-600)
    14355 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 601-700)
    14356 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 701-800)
    14357 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 801-900)
    14358 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 901-1000)
    14359 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 1001-1100)
    14360 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 1101-1200)
    14361 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (72_L 1201-1300)
 
 
COVID Moonshot designs -- see https://covid.postera.ai/covid
 
    14363 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (MOONSHOT 03-23 1-500 LR)
    14364 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (MOONSHOT 03-23 1-500 L)
    14365 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (MOONSHOT 03-26 1-1500 RL)
    14366 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (MOONSHOT 03-26 1501-3000 RL)
    14367 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (MOONSHOT 03-26 3001-4500 RL)
    14368 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (MOONSHOT 03-26 4501-5660 RL)
    14369 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (MOONSHOT 03-26 1-1500 L)
    14370 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (MOONSHOT 03-26 1501-3000 L)
    14371 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (MOONSHOT 03-26 3001-4500 L)
    14372 - FEP screening of protease inhibitors in solution  (MOONSHOT 03-26 4501-5660 L)
 
 
MLTN series
 
    14373 - FEP screening of protease inhibitors in complex (MLTN 1-100 RL)
    14374 - FEP screening of protease inhibitors in solution (MLTN 1-100 L)
 
 
14600 series - "72"
 
    14600 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 1-100)
    14601 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 101-200)
    14602 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 201-300)
    14603 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 301-400)
    14604 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 401-500)
    14605 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 501-600)
    14606 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 601-700)
    14607 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 701-800)
    14608 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 801-900)
    14609 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 901-1000)
    14610 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 1001-1100)
    14611 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 1101-1200)
    14612 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (72_RL 1201-1300)
 
 
14600 series - "AGG"
 
    14613 through 14625 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (AGG_RL)
    14630 through 14643 - FEP screening of protease inhibitors in complex  (AGG_RL)
 
 
 
 
 
Merci à toTOW qui représente l'Alliance Francophone et qui m'a aidé pour ce topic

A tous les coups c'est un virus informatique ce truc la   en plus le réseau a plutôt besoin d'être soulagé en ce moment

drap
 
folding@home est ultra connu, ce n'est pas un virus.
Je n'arrive d'ailleurs pas à retrouvé le topic officiel qui doit bien avoir plus de 20 ans. C’était notre amis tharkie qui était le taulier
je relance de mon coté, si ca peut aider

Je l'ai installé quand j'ai lu un article sur la tribune ce week-end. https://www.latribune.fr/economie/i [...] 42930.html

J'ai Linux et j'ai juste installé le paquet fahclient. Doc ici: https://foldingathome.org/support/f [...] uick-start
 

C'est bizarre, sur hfr - un vrai nid à gamers et overclockers - je pensais que ça aurait plus de succès xD
 
Je trouve le concept vraiment utile, c'est tout de même hallucinant de se dire qu'une simple idée, en mutualisant les moyens de différentes personnes, arrive à une telle puissance de calcul.
 
Ca serait bien de mettre les screenshots de nos participations respectives dans quelques semaines

Ah, je voulais faire ce genre de topic, mais avec tout ce bordel sur le projet, j'ai pas eu le temps !
 
Merci taxus !
 

La topic a disparu avec la section SETI & projets ditribués ...
 
HFR est membre fondateur de l'Alliance Francophone (équipe n°51).

Petit résumé de la situation du projet avec la dernière communication officielle (qui date de lundi) :

• Nous sommes au courant de la pénurie de WUs.
• Ceci arrive car il y a une augmentation d'environ x20 de la demande de WUs.
• Nous travaillons dessus et nous espérons avoir une solution très bientôt.
• Laissez vos machine tourner, elle finiront par plier seules.
• A chaque fois que nous doublons notre capacité, le nombre de volontaires souhaitant participer augmente d'un facteur 4, dépassant tout ce que nous faisons.

ca consomme très peu en bande passante

Hello,

J'ai également rejoint l'aventure folding@home aujourd'hui dans la team 51. Le 3600 est en plein run pour le compte de l'université de Saint Louis c'est rigolo.

Par contre je vous demande un petit retex : vous avez déjà eu du coilwhine GPU uniquement avec Folder ? Ma 1070 couine comme une p*te à la retraite.

Sympa ce retour aux sources sur Hfr de Folding@home
Salut à toutes & tous, et aux anciens de la cat. "calculs distribués" s'ils sont encore là !

 
 
Salut, j'ai une GTX 980 et je n'ai pas de coil whine, fait peut-être une recherche plus large sur Google

demarré hier :  
 

demain, je mettrais sans doute aussi mon i7 4970 sur la tache aussi

Apparemment ma carte graphique n'a jamais été autant sollicitée de cette manière (au taquet tout le long), c'est normal donc

Et encore c'est pas tout le temps.

edit : j'ai trouvé et c'est assez original, ça vient de l'affichage seconde par seconde des graphes OCCT en parralèle du travail GPU avec Folding.

moi ma 1070 dépasse pas le 50%

Ce coup de vieux : https://web.archive.org/web/2002070 [...] 2146&cat=9

mais ouais
 

 
idem hier 45%
lancé hier : 53k

Chez moi ça ne marche pas.    
L'application se lance bien, mais rien ne se passe, et quand je regarde dans la console, on dirait qu'il y a un problème de connection, ça tourne en boucle.

C'est normal, il y a "trop" de contributeurs sur ce projet, tu es certainement en liste d'attente. J'ai mis facile 1 heure avant de recevoir ma première tâche.
Je t'invite à checker tes logs

MSI Afterburner et OCCT : 100% de charge
Gestionnaire de tâche : 40 à 50%

Y a un bleme quelque part, ou alors y a une subtilité qui m'échappe.

Y'avait déjà un gros topic Folding@home avec tous les participants HFRiens (il y en avait plein), c'était un très gros topic unique, mais je ne le trouve plus

En même temps, il date d'il y a plus de 10 ans, mais c'est bizarre

 
L'explication sur les posts de totow plus haut

Hey mais WAT ?  

La cat entière Seti et projets distribués a disparu ? Et les gros topic ont disparu sans être déplacés vers discu par exemple ??

 
La majorité des HFRiens qui postent sur discu ne sont ni gamers ni overclockers

Bon par contre je vais pas laisser le PC H24 non plus, je paie déjà 80€ d'EDF par mois pour garder péniblement à 16°c un 37m² au plus fort de l'hiver
Vive les passoires énergétiques.

Le projet Seti lui même est arrêté. C'est triste qu'on ne cherche plus d'extra-terrestre.

Disons qu'elle ne va pas whine plus sous FAH qu'en jeux si elle le faisait déjà ...
 

Ne pas regarder avec le gestionnaire de tache Windows, son affichage par défaut est foireux. Tu peux l'utiliser si tu choisi de visualiser Cuda ou Compute, mais pas 3D ou Copy.
 
Sinon le plus sur, c'est de surveiller avec GPUZ par exemple.

 
ouvre l'url avec un autre navigateur
de mon coté ca tourne en boucle avec chrome, et avec FF ca marche bien

 
En faite c'est un problème connu. FAQ >> https://www.alliancefrancophone.org [...] terface-ko
 

 
C'est exactement ce que j'ai eu.

Justement le GPU n'a pas de coilwhine ingame (sauf sur les menus qui tournent à plusieurs centaines de fps)

Quelqu'un sait s'il y a moyen de modifier les mode LOW/MEDIUM/HIGH ? Le MEDIUM me gêne pour bosser tandis que le mode LOW me laisse bien trop de ressources CPU et n'utilise jamais le GPU.

Je ne crois pas que ce soit possible.
Tu fais comme moi, tu laisses le Webcontrol tourner et changes à la volée les paramètres en fonction de ce que tu es en train de faire.
Je laisse tout le temps en full sauf quand je joue, je mets sur low

C'est bien ce que je craignais, du coup j'ai mis le CPU en pause le temps que le Run GPU se finisse.

Bosser sur VM avec un CPU déjà au taquet sur 80% de ses coeurs c'est pas foufou.

J’utilise jamais le slider, il est toujours sur full ... et j'utilise encore moins le Webcontrol ...  
 
Je règle tout avec FAHControl (Advanced Control) et si j'ai besoin de puissance pour lancer un truc lourd (ou un jeux), je mets le GPU en pause à la main.

J'utilise aussi FAHC

J'ai trouvé où on pouvait régler le nombre de threads réservé au folding sur le FAHC.

Configure => Slots => CPU => Edit => premier encadré (-1 étant la valeur qui laisse le soft choisir, vous renseignez le nombre de threads pouvant être utilisés par FAH).
Ainsi j'ai pu laisser 8 threads sur 12 au folding et le proco reste à 80-90%.

Hop drap, j'ai réinstallé aussi. Il n'y a pas de team HFR ?
Tous le monde mets 51 du coup ?

wokay ! 20ème mondial    
 
Bon par contre j'ai mis le truc en 'full', laissé tourné, pc planté
 
on va repasser en light pour voir hein

 
Salut, vérifie tes températures quand t'es en full, moi je montais à 99°C, j'ai changé la pâte thermique et je tourne aux alentours de 80°C maintenant (i7 860 OC@3.8GHz)

Y'a pas meilleur test de stabilité que FAH ...