le bon shéma est celui que tu exposes cablator, à savoir les os sur des partitions principales et les données sur les étendues.
Un OS DOIT être installé sur une partition principale sinon ça bootera jamais. Win98 sur une étendue ne bootera pas. Théoriquement NT non plus, cependant certains croient que NT marche très bien sur une etendue, ce à quoi je répond oui mais c'est parce que NT différencie sa partition système de sa partition d'amorçage, la partition système ne regroupant que quelques fichiers (ntldr, boot.ini, ntdetect..etc), la partition d'amorçage pourra elle être sur un disque étendu.
Prend un part-fr, créé 3 partitions principales et une etendue (fdisk saura po faire). Tu peux créer 4 partitions (étendues ou principales) par disque (mais une seule étendue contenant x lecteurs logiques).