tu veux donc remplacer ton win98 par linux ?
là c'est différent. si tu installes Linux sur une partition FAT(16 ou 32), ca t'évite le problème d'enlever le boot loader de 2000, mais ca va être très lent sous linux puisque l'accès FAT n'est pas natif dans le noyau mais émulé... en gros ca va ramer.
si tu reformate ta partition en linux ext2 (la fat linux en gros) là tu perds le boot loader, ce qui va a mon avis totalement empecher 2000 de se lancer, et si ce n'est pas le cas ca va poser quelques problèmes puisque le lecteur C que tu connais n'existera plus, et sera remplacé par la partition de 2000. tous les liens des applications (installés en C ou D) ne marcheront plus puisque les lettres de lecteur auront été modifiées.
Le conseil que je te donne est donc de ne pas virer la partition de 98. au pire, efface 98, libère le plus de place possible, et diminue la taille de la partition au minimum possible. Installe ensuite linux dans la place que tu auras ainsi libérée. attention cependant, linux créé en général 2 partitions (ext2 et swap), donc dans le boot.ini prévoit une autre entrée tout de suite (en supplément, tu feras le ménage une fois installé) pour windows 2000 mais en incrémentant de 2 le numéro des partitions. (device(0)harddisk(0)partition(x+2))
si tu as d'autre problèmes, je risque de ne plus pouvoir venir sur le forum aujourd'hui mais tu peux m'envoyer un mail (bill.fr@iname.com)