Pour info, j'ai réussi en effectuant un test avec Winrar.
Au moment de la publication de l'application, il demande quel type de fichier nous souhaitons lui associer. Chose bizarre, il ne proposait aucune extension pour certains logiciels comme Excel.
Je me suis rendu dans Panneau de configuration\Programmes\Programmes par défaut\Définir les associations. Suite à quoi quand je suis retourné sur le citrix les extensions sont apparus pour les logiciels manquants.
Petit bug donc. Je vais regardé s'il existe un patch correctif puis je mettrai à jour ce post.
Merci