Tu as fait un début d'installation et ça s'est bloqué en cours d'installation donc :
1/ le disque est formaté en NTFS et donc non reconnu par un système Win 9x (quand tu le mets en slave, Win 9x ne le voit pas)
2/ Quand tu le mets en master, il manque des fichiers mais rien d'étonnant, Win 2000 n'a fait que commencer l'installation.
Si tu veux y mettre Win 9x, faut virer la partition non-dos (avec fdisk) puis formater en FAT 32 et installer Win.
Sinon, tu peux réessayer Win 2000, mais boot avec le CD et reformate le disque.