Pourquoi pas HandBrake ?
Je l'utilise pour convertir des DVDs de deux façons :
- Vidéos MP4/M4V, H264 avec les sous-titres incrustés (pour les lecteurs qui ne gèrent pas bien les S-T ou un iPad).
- Vidéos MKV, H264 avec les sous-titres "embarqués" (pour les "bons" lecteurs genre MPC-HC).
Libre, gratuit, excellente qualité, rapide, plutôt simple (il utilise très bien les procs multicores).
Pour les Blu-Ray, n'en ayant jamais converti, je ne sais pas s'il gère bien les sous-titres.