Ben c'est normal que ce soit pas centré. En fait, tu appliques une position absolue sur un fond qui bouge en fonction de la taille de la fenetre.
Je suppose que tu as manuellement placé l'élément sur le fond en utilisant, par exemple, la prévisualisation intégrée du logiciel et, une fois que ça te plaisait, tu as regardé ce que ça donnait avec IE non?
Evidemment la taille des fenetres est différente donc le résultat n'est pas le même, essaye de redimensionner la fenetre de IE, tu verras que ça change.
Essaye plutot de créer un <div> qui contiendra le fond (tu utiliseras la fonction CSS background-image) et dedans, tu refous un <div> que tu centreras avec des fonctions que tu trouveras sur google (cherche css center par exemple).
Bon courage 