Aide script python

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Auteur	Sujet : Aide script python

suomi

Bonjour à tous.
Je débute en python, et j'ai besoin d'un peu d'aide.
Je voudrais créer un script me permettant à partir d'un fichier.txt où il y a une chaine de caractère sur plusieurs lignes créer un autre fichier ou chaque ligne de cette chaine ne fait que 50 charactères.

voila mon oeuvre qui ne marche pas :??: :

Code :

#! /usr/bin/env python2
import string,re,sys
fasta=open("fichier.txt" ).readlines()
def write_fasta(seq, width=50):
"""write a sequence in fasta format.
The following parameters can be specified
seq - sequence as string
width - number of characters per sequence line (default 50)"""
for i in xrange(0, len(seq), width):
print seq[i:i+width]
write_fasta(fasta)

Le script m'affiche le fichier.txt mais pas avec 50 caractères par ligne.
Merci pour votre aide :hello:

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masklinn

í dag viðrar vel til loftárása

à ton avis, readlines() ca fait quoi? [:itm]

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I mean, true, a cancer will probably destroy its host organism. But what about the cells whose mutations allow them to think outside the box, and replicate and expand beyond their wildest dreams by throwing away the limits imposed by overbearing genetic r

suomi

readline lit toutes les lignes de mon fichier....

Mais pourquoi ma fonction ne marche pas.
Mon width=50 n'est pas pris en compte...

Sinon, peut etre devrais-je me tourner sur la création d'un tableau de largeur 50 que je remplit par ma chaine de caractère?

masklinn

í dag viðrar vel til loftárása

...

a ton avis, readlines ca rend quoi en sortie?

suomi

Ben en gros, f.readlines() utilise f.readline() de façon répétitive, et retourne une liste contenant toutes les lignes de données du fichier.

masklinn

í dag viðrar vel til loftárása

bien, donc dans ton exemple, SEQ c'est quoi?

suomi

J'ai apprit que les variables de fonction ne doivent pas avoir les mêmes noms que les variables du programme général.
Pour moi, seq dans la fonction corresponf a Fasta dans le programme.
Le programme met donc en mémoire, Fasta qui correspond à la liste de toutes les lignes de mon fichier et cette variable est assimilée à Seq dans la fonction.
Non?

masklinn

í dag viðrar vel til loftárása

je te demande LE TYPE de seq.

je sais bien à quoi ca correspond et pourquoi tu l'utilises, mais je veux que tu me donnes son type et que tu te poses des questions à ce propos

Valeriand

Petite aide supplémentaire:
regarder dans la doc les différences entre les fonctions readline() et read()

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