dans le fichier catalina qui demarre le serveur tomcat on trouve ce code:  
 
exec "$_RUNJAVA" $JAVA_OPTS $CATALINA_OPTS \  
      -Djava.endorsed.dirs="$JAVA_ENDORSED_DIRS" -classpath "$CLASSPATH" \  
      -Dcatalina.base="$CATALINA_BASE" \  
      -Dcatalina.home="$CATALINA_HOME" \  
      -Djava.io.tmpdir="$CATALINA_TMPDIR" \  
      org.apache.catalina.startup.Bootstrap "$@" start  
 
vous pouvez m'expliquer ce que c'est et merci!!  

C'est la commande qui lance le programme. Tout ce qui commence par $ sont des variables du shell, donc soit des variables d'environnement soit des variables définies plus haut dans le script.

 
et tout ce qui commence par -D correspont au positionnement de propriétés systèmes pour le programme (ici Tomcat)