Oui effectivement si ton système est WInCE, dans ce cas tu peux ouvrir plusieurs fenetres en m temps.
En ce qui concerne les APIs, là encore tu as raison. Les APIs WinCE sont moins développées que les APIs pour PC.
En général, les APIs mobiles sont faites de façon à coller le mieux possible aux APIs PC pour des raisons évidentes de portabilité du code. Néanmoins selon la complexité des choses, le prototypages des fonctions et méthodes peut être différent, ou garder les mêmes paramètres mais certains de ces paramètes ne seront pas utilisés.
Là il faut regarder au cas par cas, MSDN te dira ce qu'il en est.
Sinon pour revenir à ta question sur la transparence, si tu l'as fait sur PC et que ca n'a pas d'effet sur WinCE, sans doute c'est que ce n'est pas possible
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