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Auteur | Sujet : [Algo] + longue Sequence commune à 2 sequences |
Publicité | Posté le 25-05-2003 à 11:07:33 |
Taz bisounours-codeur | je regarde l'alog, mais niveau implémentation, y a du boulot! |
farib |
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Taz bisounours-codeur | putain, sur google, y a plein de resultat avec ton algo en m*, mais des fois est evoqué un algo en temps pseudo linéaire |
Evadream -jbd- | J'ai trouvé une page qui pourrait peut-être t'intéressé :
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Taz bisounours-codeur | c'est le meme aglo qui est expliqué |
Evadream -jbd- | Ok, je sors. |
Taz bisounours-codeur | http://www.csse.monash.edu.au/~llo [...] 6.IPL.html
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farib |
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Taz bisounours-codeur |
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Publicité | Posté le 25-05-2003 à 14:05:36 |
farib | bon la j'ai compris ou était l'astuce, masi j'ai pas encore compris pourquoi effectivement ca marchait
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Taz bisounours-codeur | ben comme toutes les optimsiations aggressives, c'est cahud...
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farib | bon, la g compris ce qu'il faillait faire, mais je demande que le taré qui a mis au point cette technique soit interné en maison de repos. |
farib | y'a juste son point 2.3 ke je capte pas, pour prendre une LCS il suffit de lire la dernière ligne, et pourtant lui il fait une technique super compliquée... |
Taz bisounours-codeur | doit y avoir un moyen d'améliorer les choses si les chaines sont pas de meme longueur |
farib | pour ce qui est de de trouver une PLSC, il suffit de "lire" une dernieres ligne ou colonne --------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
Taz bisounours-codeur | en tout cas je sais pas si tu as vu, mais avec seulement les 2 dernières lignes, on fait tout le boulot sans problèmes |
Taz bisounours-codeur | hey, mais j'ai bien l'impression que l'algo foire dis-donc? |
Angel_Dooglas Le dernier des humains |
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farib |
--------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
farib |
--------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
Taz bisounours-codeur | ben regarde ton exemple |
farib |
--------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
Taz bisounours-codeur | abcdefghijkl abbcdfghj
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farib |
Message édité par farib le 26-05-2003 à 12:45:59 --------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
Taz bisounours-codeur | avec ma definition c'est pas trivial, mais la tienne je la comprends pas, on dirait l'interesction d'ensemble |
farib |
--------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
Angel_Dooglas Le dernier des humains |
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farib | le probleme c'est qu'on l'appelle plsc Message édité par farib le 27-05-2003 à 00:37:06 --------------- Bitcoin, Magical Thinking, and Political Ideology |
Angel_Dooglas Le dernier des humains | Ce qui est qualifie de sous chaine ici est en fait la plus longue chaine commune possible avec gaps:
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Taz bisounours-codeur | __avec__ des gaps... la notion de chaine/sequence en prends un coup... mais si ça te satisfait |
Angel_Dooglas Le dernier des humains | Sans gaps, on ne s'en sort pas dans les sequences biologiques. Par contre cette maniere de faire n'est absolument pas interressante pour trouver des alignements biologiquement satisfaisants.
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