Non, le problème vient du tracking des fichiers. Si tu passes par une compilation directe (générique), tu te retrouves avec un/des binaires installés aux 4 vents et dont tu perds la trace (pas tout à fait vrai si tu conserve le dossier de compilation original). Ton gestionnaire de paquets n'a aucun moyen de savoir que tu as installé des logiciels à la main. Par ailleurs, ta distribution peut utiliser des répertoires d'installation différents de ceux configurés par défaut.
Tout ça peut entraîner des conflits de dépendances, de versions ou de variables d'environnement bien pénibles à diagnostiquer.
Par ailleurs, configure/make n'est pas la solution universelle même si c'est la plus répandue pour les outils en lignes de commande. Il existe d'autres méthodes de déploiement (ex: cmake pour bcp de sources Qt4, setuptools pour python,...) suivant le type des sources et les choix de l'auteur.
Message édité par BloodyCarnage le 27-07-2011 à 11:04:33