Bonjour,
 
Je travaille sous Illustrator 10 sur un plan complexe. Le plan comporte des calques et des sous-calques. Quand je veux copier une partie dans un nouveau fichier, je sélectionne la zone. J'active l'option "Coller selon les calques". Je vais dans le nouveau fichier. Et je colle Ctrl+V. Je récupère bien les calques mais à l'intérieur de chaque calque, il n'y a pas de sous-calques, tout est mis ensemble. Il y a une méthode pour coller en préservant aussi les sous-calques?

Tient, je retombe sur mes propres questions un an plus tard quand je refais des recherches sur le même problème.
 
Donc, problème toujours non résolu. Je le rencontre aussi avec les groupes dans les sous-calques. Quand on copie, on retrouve aussi tous les groupes à la racine.
 
Sinon, contournement trouvé: je ramène tous mes sous-calques à la racine.