ça dépend.
A temps plein, si tu as 25 jours de congés / an tu ne comptes pas le samedi. Si tu en as 30, tu comptes le samedi même si tu ne le travaille pas d'habitudes.
A temps partiel, si tu as 25 jours de congés par an, pour prendre une semaine de congés tu déduis 5 jours de tes CP (même les jours où tu ne travailles pas d'habitudes, donc).