Je n'ai pas testé mais le moyen gratuit et peut-être le plus adapté, si tes équipements sont du Cisco, est d'activer le netfow sur les équipements puis un soft pour réaliser les graphes. Cacti possède a priori un plugin permettant de faire cela:
http://docs.cacti.net/plugin:flowview
Sinon, il faut mettre une sonde à l'endroit "stratégique" sur ton réseau, ie le point de passage prinicpal de tes flux, en utilisant un hub ou en faisant du mirroring du port où passe ton trafic. Tu peux utiliser bandwidth pour cela, comme dit plus haut.