dans un domaine windows 2000, il n'y a plus de domain controller principal et secondaire (ca c'est en cas de domaine nt4), ils sont chacun aux mêmes point (même si c'est vrais que le premier domain controller contient de schema du domaine).
dans le cas d'une nouvelle installation d'un domain controller, celui ci va copier l'active directory de celui qui est encore sur le domaine, et dans ce cas tu retrouvera tes accès.
si tu sais récupérer ton ancien domain controller, au démarage presse F8, et tu auras les options de récupération du serveur.
bon, si j'ai pas bien compris ton problème rééxplique, car c'est pas très clair.