Pour le premier, ca dépend de chacun. Partition magic a l'air d'être souvent utilisé. Personnellement, je préfère le gestionnaire de disque de XP/2000 (ou FDisk pour Win98).
Chaque partition est indépendante, tu peux créer/supprimer/reformater chaque partition sans toucher aux autres. Pour l'install d'un OS, faut juste faire attention avec le multi-boot.