Bonjour,  
J'utilise actuellement W98 avec 2 disques durs (un pour le systeme et un pour les données) en FAT32. Je souhaiterai passer à XP en l'installant sur mon disque dur "systeme" qui va donc passer en NTFS mais comment faire pour mon disque dur "données" ? Si je le passe en NTFS je vais perdre tout ce que j'ai dessus non ?

non pas du tout, soit tu le laisse en fat 32 et pas de souci...
Soit tu le converti en NTFS ( sous XP ) avec la commande convert x: /FS:NTFS ( si je me souviens bien, à confirmer )