la plupart des logiciels de sauvegarde "moyenne et haut de gamme" de type Tina, Data Protector, Netbackup font des sauvegardes et des restauration par boite en se branchant sur les API de Exchange, donc c'est pas très rapide mais ça se fait bien.
si tu es en environnement full windows, regarde du côté de BackupExec, ça peut suffire selon ta config.