En fait, pour le stockage de données, les applications Mozilla utilisent des "fichiers indexés" (l'un contient les données, l'autre -assez petit- dit juste où elles se trouvent).
Dans ce genre de système, la suppression de données (quand tu supprime un e-mail) créer des trous dans le fichier de données (il s'agit d'un compromis afin de garder un certain niveau de performance).
Périodiquement il faut faire une opération de maintenance afin de retirer ces trous (voir la procédure de weed) : les mails en fin de fichiers vont être déplacés dans ces trous, ainsi la taille globale du fichier diminue (pour être égale la taille totale des vraies données utiles, non supprimées).
Donc en fait ton fichier "Trash" est plein de trous qui prennent de la place. Ce fichier est nécessaire et Mozilla le recréer car il en a besoin.