en cour, ont nous demande de mettre une ligne de commande sur un Server pure ftp pour n'autoriser que certaine extension sur les commun de ce mémé Server,  
quelqu'un connaitrai un début de piste pour que les client ne puisse mettre n'importe quoi sur le Server.merci de votre réponse

En gros je dirai que c'est impossible, puisque ca n'empêche pas l'utilisateur de changer le nom du fichier avant upload.
 
Au pire, les fichiers cachés (commençant par "." )  peuvent être non modifiables/non lisibles. Et encore une fois, rien ne dis que l'upload de ces fichiers est interdit.
http://download.pureftpd.org/pub/pure-ftpd/doc/FAQ

Ça ne sert à rien en soit, mais j'ai un super début de piste :
man pure-ftp !!