Nimda commençait à me gonfler sérieusement et mes logs aussi ( 
 )
Donc, j'ai fait des petites recherches et voici un mix qui semble fonctionner à merveille.
Dans httpd.conf
Le but est d'empêcher le log de tout tentative d'accès par nimda.
ajoutez
SetEnvIf Request_URI \cmd.exe|\root.exe nimda
(c'est bien URI et non pas URL !)
modifiez
Customlog /../../access_log common env=!nimda
 
Le but est d'empêcher le log d'erreur 404 créé par nimda.
Ajoutez dans le  
<IfModule mod_alias.c>
  RedirectMatch (.*)\root.exe$ http://NimdaIsNotForMe.invalid$1
  RedirectMatch (.*)\cmd.exe$ http://NimdaIsNotForMe.invalid$1
</IfModule>
 
voila c'est tout. Si un jour vous en avez besoin...