1 - Certaines cartes AGP et PCIe n'ont pas un "vrai" port AGP, et du coup, ça ne marche qu'avec certaines cartes.
2 - Il faudrait avoir une idée de ce que tu veux prendre pour te répondre (AMD -> DDR, P4 -> DDR ou DDR2). Maintenant, niveau perfs, la DDR2 n'atteint pas pour le moment les timings de la DDR "simple".
3 - D'après ce que je sais, toutes les CMs ont encore des ports ATA, donc pas de soucis.