Le principal, c'est que le disque avec le système et le SWAP fonctionne bien. Pour ça, il vaut effctivement mieux qu'il ne soit pas trop rempli, et la mémoire cache aide un peu
Mais en disque secondaire, tu fais ce que tu veux, tu peux le remplir à ras si tu veux, ça n'aura aucune mauvaise influence sur ton système