Tout dépend de ce que tu veux faire.
Si c'est simplement d'accéder aux données, Vista saura lire les partitions de ton disque IDE sans problème.
Si maintenant tu veux pouvoir utiliser également windows 98, il faut soit prévoir un double boot (voir les posts sur ce sujet) ou choisir au démarrage du PC le disque à lire en 1er, le disque IDE devant sant doute avoir son MRB prévu pour lancer windows 98.