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  Help Cure Muscular Dystrophy - Décrypthon - Téléthon

 


 Mot :   Pseudo :  
 
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Auteur Sujet :

Help Cure Muscular Dystrophy - Décrypthon - Téléthon

n°1682175
Jean920
Posté le 20-12-2006 à 14:04:30  profilanswer
 

http://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/a05%20a-08h.jpg
Recherches sur les maladies neuromusculaires et la myopathie de Duchenne
Projet Lancé le 19 décembre 2006 sous la plateforme multi-projets World Community Grid
 
 
 
L'Alliance Francophone :
 
Site Internet : http://www.boinc-af.org/
Forum : http://www.boinc.fr/
 
 
World Community Grid
http://www.worldcommunitygrid.org/
 
 
Decrypthon
http://www.decrypthon.fr/
 
 
 
PLAN DU POST :
 

  • Avant propos, Tordre le cou à quelques idées reçues sur le calcul partagé
  • Introduction
  • Résumé du projet
  • Configuration Minimale pour participer
  • Plus d'Infos sur le projet
  • Comment participer au projet - Guide D'Installation et de mise en route du projet pas à pas
  • Comment se rendre sur son compte et choisir son projet
  • Rejoindre l'Alliance Francophone
  • Le Logiciel
  • Comment utiliser 100% du processeur


 
http://www.worldcommunitygrid.org/images/agent/hcmd_agent.jpg
 
Avancement de la première phase du projet :
 
http://graal.ens-lyon.fr/%7Erbolze/img/wcg/wcg_progression_02-05-2007.png
 
Le graphique ci-dessus représente l'avancement du projet HCMD.
 
   

  • L'axe des ordonnées représente le pourcentage cumulé du temps CPU estimé.

 

  • L'axe des abscisses représente le pourcentage cumulé des protéines.

 

  • La partie verte représente les protéines qui ont été traité par les internautes participant au WorldCommunityGrid

 

  • La partie rouge représente les protéines en attentes d'être traitées ( ou en cours de calcul)


 
 

Avant propos, Tordre le cou à quelques idées reçues sur le calcul partagé

 
Pour participer à un projet de calcul distribué :
- Il n'y a pas besoin d'être connecté constament à internet, quelques minutes ou dizaines de minutes par jour suffisent au logiciel pour télécharger les unités qui seront ensuite calculées par votre processeur.
- Il n'y a besoin de rien changer à ses habitudes, si votre ordinateur reste allumé qu'une heure par jour, le programme s'adaptera. Avant que votre ordinateur s'éteigne, le programme sauvegarde automatiquement tous les calculs que vous avez dejà effectués, et ces calculs reprennent automatiquement lorsque vous redémarrez votre ordinateur.
- ça va ralentir mon ordinateur --> non, le logiciel a une priorité basse (si vous avez besoin de x% du processeur pour n'importe quelle application, l'UD Agent libére instantanément le processeur et n'utilise que 100-x%)  
De plus le logiciel est peu gourmand en mémoire Ram il n'a besoin que de 10 à 15 Mo pour fonctionner (par comparaison Firefox ou Emule sont souvent à plus de 50 Mo). On ne ressent même pas qu'un logiciel de calcul partagé est installé.
Au final c'est le programme qui s'adapte à vos habitudes et non pas vous qui vous adaptez au programme. Une fois qu'il est installé, vous n'avez rien de plus à faire que de laisser le logiciel gérer les calculs lui même.
Tout au plus si vous le souhaitez vous pouvez voire les calculs avancer par l'intermédiaire de votre écran graphique, et suivre vos statistiques personnelles ou celles de votre équipe réfletant le travail fournis pour le projet.
Pour vous en rendre compte le plus simple c'est d'essayer, ça n'engage à rien. Si vous n'êtes pas convaincu vous pouvez désinstaller immédiatement le logiciel.
 
 
Introduction :
 
http://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/dd%20l2-374h.jpg
Help Cure Muscular Dystrophy représente un des projets du Decrypthon.
La plupart des projets du Decrypthon fonctionne sur des grilles universitaires (Bordeaux I, Lille I, Paris VI, Orsay, l’ENS Lyon et du Crihan à Rouen)
La particularité de Help Cure Muscular Dystrophy est d'être ouverte à tout les particuliers à travers le monde.
Pour participer, il suffit juste d'avoir une connection internet et un ordinateur.
 
Par contre, mauvaise nouvelle, la phase 1 du projet est exclusivement disponible sur l'Agent United Device, et pour l'instant uniquement sous Windows
Donc pour ceux qui veulent vraiment participer à ce projet, vous n'avez pas le choix de la plateforme, ni du système d'exploitation.
Cette première phase devrait durer 2 mois. Après ces 2 mois, les scientifiques du projet vont examiner les résultats. Si les résultats sont concluant, ils vont préparer la deuxième phase du projet.
Cette 2ème phase devrait commencer si tout va bien en Août 2007. Cette phase s'inscrit dans le long terme, pourquoi pas plusieurs années.
C'est pour cette raison que la phase 2 du projet Help Cure Muscular Dystrophy sera disponible sur les 2 plateformes Boinc et UD Agent, pour disposer d'une puissance de calcul suffisante aux recherches.
A ce moment là on vous encouragera à migrer sur la plateforme BOINC, puisqu'il est plus transparent de faire fonctionner un projet de calcul partagé sur un logiciel libre et Open Source issu du fruit du travail d'une Université (Université de Berkeley), plutôt que sur un logiciel d'une entreprise comme United Device
 
 
 
Résumé du projet :
 
http://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/fa%20p1-09h.jpg
La communauté du World Community Grid et celle des chercheurs soutenus par le Programme Décrypthon, un partenariat entre l'AFM, le CNRS et IBM, lancent un ambitieux projet d'assemblage moléculaire. Il s'agit d'étudier la modélisation des interactions protéine-protéine de 40 000 protéines dont la structure tridimensionnelle (structure 3D) est connue, en se concentrant sur les protéines qui jouent un rôle dans les maladies neuromusculaires. Les informations obtenues seront rassemblées dans une base de données pour aider les chercheurs à concevoir les molécules susceptibles d'inhiber ou de favoriser la liaison de molécules particulières. L'objectif est de pouvoir trouver des traitements contre les myopathies et d'autres pathologies neuromusculaires.
 
Que sont les maladies neuromusculaires et la myopathie de Duchenne ?
Le terme générique « maladie neuromusculaire » désigne un groupe de maladies (plus de 200 au total) qui affectent le fonctionnement des muscles, soit en touchant directement le muscle, soit indirectement en touchant le nerf moteur ou la jonction entre le nerf et le muscle. La plupart de ces maladies sont rares (moins d'une personne sur 2 000 est affectée), elles sont d'origine génétique (80% des cas) et affectent aussi bien les enfants que les adultes. Ces maladies chroniques conduisent à une diminution de la force musculaire et occasionnent un handicap sévère de la fonction motrice (mouvements, respiration, etc.). Les manifestations de ces maladies sont variables. Certaines sont progressives alors que d'autres peuvent rester stables durant plusieurs années. De plus, la même pathologie peut produire des symptômes différents d'une personne à l'autre. Malgré les avancées des approches thérapeutiques, il n'existe à ce jour aucun traitement curatif disponible pour traiter ces maladies.
 
 
Configuration Minimale pour participer :
 
- Pentium 550 Mhz ou équivalent
- 60 Mo de Mémoire Ram
- 25 Mo d'espace disque disponible
- résolution d'écran 800x600
- Connection internet 40 Kbits
- Windows 98, ME, 2000 or XP
 
 
 
Plus d'Infos sur le projet :

A propos du projet
Participants aux recherches
FAQ du Projet
FAQ Ecran graphique
Forum du projet

 
 
 
Comment participer au projet - Guide D'Installation et de mise en route du projet pas à pas :
 


Message édité par Jean920 le 03-05-2009 à 12:14:51
mood
Publicité
Posté le 20-12-2006 à 14:04:30  profilanswer
 

n°1682186
Jean920
Posté le 20-12-2006 à 15:11:23  profilanswer
 


 
 
 
Les options de son compte
 
 
 
Comment se rendre sur son compte et choisir son projet :
 
Appuyer sur ce lien
 
Lors de votre première visite un message de bienvenue vous est présenté.
Il vous est demandé de choisir le ou les projet(s) pour le(s)quel(s) vous voulez participer.
Si vous voulez participer qu'à Help Cure Muscular Dystrophy, il faudra décocher tous les autres projets.
--> Continuez
http://www.boinc-af.org/images/Decrypthon/decr22.jpg
 
 
Maintenant vous êtes sur votre compte, c'est là que vous pouvez choisir votre équipe. (Mon équipe)
 
 
 
Rejoindre l'Alliance Francophone
 
Appuyez sur ce lien
 
Tappez L'Alliance Francophone puis recherchez :
http://www.boinc-af.org/images/Decrypthon/decr24.jpg
 
 
Appuyez sur le lien, L'Alliance Francophone :
http://www.boinc-af.org/images/Decrypthon/decr26.jpg
 
 
Puis Rejoindre cette équipe :
http://www.boinc-af.org/images/Decrypthon/decr28.jpg
 
 
 
Voilà, vous êtes membre de l'Alliance Francophone !
http://www.boinc-af.org/images/Decrypthon/decr30.jpg
 
 
 
Veuillez posez vos questions  sur ce topic pour toute aide technique et/ou demande d'informations supplémentaires à propos du projet Help Cure Muscular Dystrophy


Message édité par Jean920 le 03-05-2009 à 12:15:26
n°1682197
celtar
Certifié Cores@home à 93%
Posté le 20-12-2006 à 16:38:46  profilanswer
 

Dommage qu'ils ne démarrent pas sur BOINC
Travail énorme Jean920


---------------
Code Remise - Les Roadrunners
n°1682200
Jean920
Posté le 20-12-2006 à 16:45:01  profilanswer
 

Le Logiciel
 
http://www.boinc-af.org/images/WCG/wcg3.jpg
 

  • En haut à gauche, le nom du projet en cours de traitement, et sa description :


Citation :

Muscular_Dystrophy
Help Cure Muscular Dystrophy
Votre ordinateur calcul les intéractions protéine-protéine en se concentrant sur les protéines qui jouent un rôle dans les maladies neuromusculaires. Les résultats produits aideront les chercheurs à travers le monde à mettre au point de meilleurs traitements contre la dystrophie musculaire


 

  • En bas à gauche

Task Run Time: temps dejà passé à calculer l'unité en cours de traitement
Task Execution Progress : avancement de l'unité
Learn about this Project : Lien pour se rendre à la description du projet sur le site du WCG.
 

  • En haut à droite

Pseudo
Cumul des points
Durée total d'exécution du logiciel
Lien pour aller voire ses statistiques détaillées (View your score)
 

  • En bas à droite

Informations sur la configuration
Overall (ensemble), Processor (Processeur), Memory (mémoire Ram), Storage (Stockage), Network (réseau)
 
 
 
 

  • Menu : tout en bas à droite

La flèche noire vers le bas sert à fermer la fenêtre tout en gardant le programme allumé
Point d'interrogation : pour ouvrir l'aide du projet
Lune : mettre le programme en pause pendant 5 minutes (durée à régler dans les préférences)
 
Petit carré coché : préférences
 
http://www.boinc-af.org/images/WCG/wcg5.jpg
Durée du bouton pause ( Snooze sleeps for ....  minutes)
Configuration du Proxy pour les modems
 
i entouré : écran graphique.
 
http://www.boinc-af.org/images/WCG/wcg4.jpg
 
Explications :
 

Citation :


Que représentent les deux noms (e.g. 1ATN_r_u and 1HE1_r_u) dans le cercle en bas
à gauche ?

 
Ces deux chaines de caractères représentent le nom de code pdb des deux protéines qui sont actuellement en cours d'analyse. Ces protéines proviennent d'un banc d'essai établi pour l'étude des interactions protéique. Elles ont été sélectionnées car elles sont toutes impliquées dans au moins un complexe protéine-protéine. De plus elles couvrent un large spectre de structures et fonctions protéiques sans pour autant avoir de redondances.
 
Vous pouvez avoir plus d'information sur les protéines en question en visitant l'adresse suivante : http://www.rcsb.org/pdb/explore/ex [...] ureId=1ATN, http://www.rcsb.org/pdb/explore/ex [...] ureId=1HE1
 
 
Les 4 dernières lettres du lien représentent le nom de code de la protéine. Une représentation graphique est montrée dans la fenêtre principale, les couleurs étant les même que celles utilisées pour le nom de code des protéines. Vous pouvez trouver plus de détails sur la banque benchmark dans la référence scientifique suivante : J.Mintseris, K, Wiehe, B. Pierce, R. Anderson, R. Chen, J. Janin and Z.Weng, Protein-protein docking benchmark 2.0: An update, Proteins 20, 214 (2005) http://www3.interscience.wiley.com [...] 3/ABSTRACT
 

Que représente Erelec et Etmin dans le cercle en haut à gauche ?

 
Le but du programme d'amarage entre deux protéines est de trouver la configuration spatiale qui favorise le complexe entre ces deux protéines. La qualité de cette interaction entre deux protéines est évaluée par une énergie d'interaction Etmin ( exprimée en kcal/mol). Le terme Erelec représente la contribution electrostatique dans l'energie d'interaction. Cette energie dépend directement des charges electriques dans toute la protéine. Plus l'energie d'interaction est négative,plus l'interaction protéine-protéine est forte.
 
Vous pouvez trouver plus de détails sur l'amarrage entre deux proteines dans la référence scientifique suivante : M. Zacharias, Protein-protein docking with a reduced protein model accounting for side-chain flexibility, Protein Science 12,1271 (2003) http://protsci.highwire.org/cgi/co [...] /12/6/1271
 
 
Que représente la barre de progression : current progress ?
 
La puissance de calcul de votre ordinateur est utilisée pour calculer la meilleure configuration pour l'amarrage entre les deux protéines Elle représente l'avancement des calculs de l'énergie d'interaction pour un ensemble de configuration possibles entre les deux protéines.


 
 
 
 
Comment utiliser 100% du processeur
 
Pour les dual core ou l'HT, ce tuto ne marchera pas puisque l'Ud Agent n'exécute qu'un seul calcul à la fois. Il n'y a que BOINC qui est capable de calculer plusieurs unités en même temps
 
Télécharger ce logiciel
L'ouvrir
http://www.boinc-af.org/images/WCG/wcg2.jpg
 
http://www.boinc-af.org/images/WCG/wcg1.jpg
cocher la case User defined.
Faire glisser la Flèche jusqu'à 100%
--> OK
 
http://www.boinc-af.org/images/WCG/wcg6.jpg
--> OK
 
Se rendre sur l'écran graphique, si il y a bien marqué CPU THROTTLE : 100% ; c'est que l'opération a réussi.
 
Vous pouvez supprimer l'exécutable téléchargé (WCGridMaxCPU), à moins que vous vouliez rechanger la charge CPU plus tard, dans ce cas gardez le dans un coin.


Message édité par Jean920 le 28-12-2006 à 12:44:25
n°1682307
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 21-12-2006 à 07:15:39  profilanswer
 

Pourquoi ils démarrent pas sur boinc d'ailleurs??
Ils toucheraient plus de monde. [:mrbrelle]

n°1682398
Jean920
Posté le 21-12-2006 à 17:56:40  profilanswer
 

NHam a écrit :

Pourquoi ils démarrent pas sur boinc d'ailleurs??
Ils toucheraient plus de monde. [:mrbrelle]


 
Pour l'instant ils n'ont pas besoin d'une puissance de calcul énorme. Ils vont tester et calibrer l'application durant 2 mois, analyser les résultats et si c'est concluant ils vont passer à la phase 2.
Ce n'est que lors de la 2ème phase lancé en Août 2007 qu'il leur faudra un maximum d'ordinateurs, c'est là qu'ils feront "appel" aux ordinateurs sous Boinc.


Message édité par Jean920 le 21-12-2006 à 17:58:01
n°1682634
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 22-12-2006 à 14:04:40  profilanswer
 

Excellent boulot [:powa]
Il manque les balises [img] sur les images à partir du commencement de l'install ;)
 
Corrections :  
En tête :
Projet Lancé le 19 décembre 2006 sous la plateforme multi-projetS World Community Grid
 
Avant propos :
(...)le programme sauvegarde automatiquement tout tous les calculs
(...)ces calculs reprennent automatiquement lorsque vous redémarrer redémarrez votre ordinateur
- ça va ralentir mon ordinateur --> non, le logiciel a une priorité base basse
Pour vous en rendre compte le plus simple c'est d'essayer, ça n'engage à rien. Si vous n'êtes pas convaincu vous pouvez déSinstaller immédiatement le logiciel.
 
Guide D'Installation et de mise en route du projet pas à pas :
Pour l'instant comme dis dit plus haut
--> Message de Bievenue Bienvenue - Next >
le logiciel se connecte juste quelques minutes par jours jour
tout le reste des calculs se font fait hors connection.  
C'est ce qui constitue un des principal principaux reprocheS fait à  
 
Comment se rendre sur son compte...
il faudra décocher tout tous les autres projets

n°1682635
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 22-12-2006 à 14:13:03  profilanswer
 

J'ai rédigé une proposition de news pour Marc :

 


Téléthon : recherches sur les maladies neuromusculaires et la myopathie
L'équipe du Forum Hardware.fr s'implique dans le Décrypthon qui est la version informatique du Téléthon. Vous trouverez toutes les informations utiles pour nous rejoindre dans ce sujet du forum : http://forum.hardware.fr/hfr/Setie [...] 6595_1.htm
Merci de votre participation à ce noble projet.

Message cité 1 fois
Message édité par Black Hole Sun le 22-12-2006 à 14:13:14
n°1682642
Jean920
Posté le 22-12-2006 à 14:47:31  profilanswer
 

Black Hole Sun a écrit :

Excellent boulot [:powa]


 :jap:  
 

Black Hole Sun a écrit :


Il manque les balises [img] sur les images à partir du commencement de l'install ;)


 
Elles sont mises mais apparement on a le droit qu'à un nombre limité d'images  :(  
 

Black Hole Sun a écrit :


Corrections :  


 
 Fait  :jap:  
Je me demande si je laisse ou si j'enleve la partie "Avant propos, Tordre le cou à quelques idées reçues sur le calcul partagé", pour fair plus court  :??:  

n°1682643
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 22-12-2006 à 14:48:08  profilanswer
 

nan, laisse ;)

mood
Publicité
Posté le 22-12-2006 à 14:48:08  profilanswer
 

n°1682644
Jean920
Posté le 22-12-2006 à 14:49:41  profilanswer
 

Black Hole Sun a écrit :

J'ai rédigé une proposition de news pour Marc :
 
 
Téléthon : recherches sur les maladies neuromusculaires et la myopathie  
L'équipe du Forum Hardware.fr s'implique dans le Décrypthon qui est la version informatique du Téléthon. Vous trouverez toutes les informations utiles pour nous rejoindre dans ce sujet du forum : http://forum.hardware.fr/hfr/Setie [...] 6595_1.htm
Merci de votre participation à ce noble projet.


 
Si tu veux rajouter une image, dans la news :  
http://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/brin_adn.gifhttp://www.decrypthon.fr/e_img/charte/logo_decrypthon.gifhttp://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/a05%20a-08h.jpg
http://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/fa%20p1-09h.jpghttp://www.decrypthon.fr/e_img/chapitres/dd%20l2-374h.jpg
....


Message édité par Jean920 le 22-12-2006 à 15:15:44
n°1682645
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 22-12-2006 à 14:50:30  profilanswer
 

Au lieu de les baliser en [url] remplace celles qui ne s'affichent pas en balises [img]

n°1682646
Jean920
Posté le 22-12-2006 à 14:53:36  profilanswer
 

Black Hole Sun a écrit :

Au lieu de les baliser en [url] remplace celles qui ne s'affichent pas en balises [img]


Oui elles sont tous en [img] [/img]
Mais elles passent pas, je crois bien qu'on a le droit qu'à 10 images par message.
Sur boinc.fr, le message a la même structure et les images passent sans problème : http://forum.boinc.fr/boinc/News/H [...] -110-1.htm


Message édité par Jean920 le 22-12-2006 à 14:55:03
n°1682655
Astro 111
Red Orchestra 2 - Squad
Posté le 22-12-2006 à 15:28:50  profilanswer
 

La durée d'un calcul est de combien de minutes ou d'heures ?
 
A+


---------------
Alternatives à Facebook, Skype, ...  • En finir avec les rasoirs jetables
n°1682657
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 22-12-2006 à 15:32:38  profilanswer
 

Test avec les balises [img] au lieu de [url]

 

Bon, ça veut pas, même en faisant un mix des [img] et [url] :??:

 

Pour contourner le problème, il faudrait que tu splittes le post en 2. Tu édites le 3ème post du topic (qui est à toi), et tu mets dedans le morceau où les images ne passent pas.

 

Et restera à demander à Ttienne de supprimer son post [:spamafote]


Message édité par Black Hole Sun le 22-12-2006 à 15:38:23
n°1682659
Jean920
Posté le 22-12-2006 à 15:52:57  profilanswer
 

Astro 111 a écrit :

La durée d'un calcul est de combien de minutes ou d'heures ?
 
A+


 
ça doit tourner aux alentours de 2 heures, tout dépend du processeur

n°1682694
Jean920
Posté le 22-12-2006 à 19:49:35  profilanswer
 

http://www.worldcommunitygrid.org/ [...] read=10733
 
Si vous avez une unité qui dépasse les 100%, il faut l'annuler, sinon elle se termine jamais. Le problème viendrait d'un bug des checkpoints (points de passage)
Pour résoudre le problème ils ont sortie une nouvelle version 1.0.1.1.
 
Pour connaitre la version de l'application (savoir si c'est l'ancienne version 1.0.1.0 qui pose problème, ou la nouvelle application qui ne pose à prioris aucun problème)
Appuyer sur le bouton avec un i entouré en bas à gauche.
L'écran graphique se met en route et c'est là qu'on peut se renseigner sur la version de l'Application
 
 
Pour annuler une unité.
Appuyer sur les touches Ctrl Alt Suppr en même temps  
Allez dans l'onglet Processus
Trouver le processus wcgridHCMD.exe, le sélectionner  
Appuyer sur Terminer le Processus
Puis répondre oui au message d'avertissement.
L'unité est annulée, et l'Agent va télécharger une nouvelle unité


Message édité par Jean920 le 22-12-2006 à 20:39:23
n°1683866
ganryu22
Posté le 27-12-2006 à 16:23:50  profilanswer
 

très bonne idée ce projet, et carrément plus utile que de chercher des bonshommes verts...

n°1683875
Le Profana​teur
Passéiste désincarné
Posté le 27-12-2006 à 17:26:13  profilanswer
 

pas tout lu, mais on peut le mettre dans Boinc ? comme SETI , climate, µfluids... ?

n°1683884
Jean920
Posté le 27-12-2006 à 17:36:27  profilanswer
 

Le Profanateur a écrit :

pas tout lu, mais on peut le mettre dans Boinc ? comme SETI , climate, µfluids... ?


 
Non, la phase 1 va durer 2 mois et ça ne sera que sur l'UD Agent
Sur Boinc ça ne commencera qu'en Août 2007, lors de la phase 2 du projet.
 
Pour ceux qui ne veulent pas quitter Boinc, il faudra attendre cette date.
Pour patienter il y a dejà pas mal de projet médicaux sur Boinc :
Rosetta, Proteins (projet de l'Ecole Polytechnique) Tanpaku, Malaria (ouverture des comptes le 4 Janvier 2007), Docking, Simap (projet périodique, les 1 et 15 du mois)
Ainsi que les projets World Community Grid sous Boinc : Help Defeat Cancer, Fiocruz Genome Comparaison, FightAids


Message édité par Jean920 le 27-12-2006 à 17:40:50
n°1683885
Le Profana​teur
Passéiste désincarné
Posté le 27-12-2006 à 17:37:40  profilanswer
 

Merci :jap:

n°1683894
nantais
Posté le 27-12-2006 à 18:04:29  profilanswer
 

je  me suis inscrit ca y est
par contre impossible de rejoindre la team
 
edit: ca mange méchamment du cpu (50%)

Message cité 1 fois
Message édité par nantais le 27-12-2006 à 18:20:49
n°1683902
laxou
bof bof ...
Posté le 27-12-2006 à 18:15:08  profilanswer
 

ya un lien mauvais sur lapage de proteins@home sur le site de l AF !
celui pour son compte pointe vers le truc de l AF et pas sur le truc perso.


---------------
Keep cool, have fun. Always. | in :o i trust
n°1683907
ula
GT : Douglas Riper
Posté le 27-12-2006 à 18:23:58  profilanswer
 

laxou a écrit :

ya un lien mauvais sur lapage de proteins@home sur le site de l AF !
celui pour son compte pointe vers le truc de l AF et pas sur le truc perso.


en clair votre compte pointe vers http://biology.polytechnique.fr/pr [...] ?teamid=31 au lieu du compte personnel
sur cette page http://www.boinc-af.org/index.php? [...] Itemid=219

 

C'est ca ? [:arn0]

 

si c'était ça c'est corrigé :)


Message édité par ula le 27-12-2006 à 18:27:56
n°1683915
laxou
bof bof ...
Posté le 27-12-2006 à 18:33:05  profilanswer
 

wala c est bon :)


---------------
Keep cool, have fun. Always. | in :o i trust
n°1683917
Donzeky
Le bleu c'est la vie.
Posté le 27-12-2006 à 18:40:41  profilanswer
 

Hop drapo


---------------
Dans les magasins de lingerie, on ne voit pas de calendriers avec des photos de garage. (JCVD)
n°1683928
power600
Schtroumpférateur grognon
Posté le 27-12-2006 à 19:00:17  profilanswer
 

http://www.hardware.fr/news/lire/27-12-2006/
 
 :jap: à Marc

Message cité 1 fois
Message édité par power600 le 27-12-2006 à 19:00:46

---------------
Schtrompférateur aigri blasé de la vie avec pas de sens de l'humour qui ferait du bien et avec pas de neurone qui marche sinon ça se saurait
n°1683938
Jean920
Posté le 27-12-2006 à 19:14:11  profilanswer
 

nantais a écrit :

je  me suis inscrit ca y est
par contre impossible de rejoindre la team
 
edit: ca mange méchamment du cpu (50%)


 
Bizarre que tu arrive pas à rejoindre la team :
Il suffit d'aller ici : http://www.worldcommunitygrid.org/ [...] 0MV6V88PP1
D'appuyer sur Rejoindre cette équipe.
Par contre c'est vrai que par moment il y a une mise à jour des données statistiques du projet. Dans ce cas il y a un décompte de fait et il faut réessayer plus tard pour pouvoir accéder à la fiche de description de la team
 
Pour les 50%, oui c'est le but du calcul distribué, utiliser le processeur pour faire des calculs. Ici ces calculs servent à modéliser les interactions protéine-protéine. En se concentrant sur les protéines qui jouent un rôle dans les maladies neuromusculaires
L'UD Agent n'exploite pas le Dual Core ou l'Hyper-Threading, d'où les 50%. Sur Boinc on est à 100% par défaut.
Plus on utilise un % élevé du processeur, et plus on fait avancer la recherche.
Avec Boinc 5.8.0, (version actuellement en développement) il sera possible de spécifier le pourcentage du processeur que l'on veut voir calculer.

Message cité 1 fois
Message édité par Jean920 le 27-12-2006 à 19:26:36
n°1683939
ula
GT : Douglas Riper
Posté le 27-12-2006 à 19:15:41  profilanswer
 


Oui effectivement merci Marc :)

n°1683943
nantais
Posté le 27-12-2006 à 19:29:40  profilanswer
 

Jean920 a écrit :

Bizarre que tu arrive pas à rejoindre la team :
Il suffit d'aller ici : http://www.worldcommunitygrid.org/ [...] 0MV6V88PP1
D'appuyer sur Rejoindre cette équipe.
Par contre c'est vrai que par moment il y a une mise à jour des données statistiques du projet. Dans ce cas il y a un décompte de fait et il faut réessayer plus tard pour pouvoir accéder à la fiche de description de la team
 
Pour les 50%, oui c'est le but du calcul distribué, utiliser le processeur pour faire des calculs. Ici ces calculs servent à modéliser les interactions protéine-protéine. En se concentrant sur les protéines qui jouent un rôle dans les maladies neuromusculaires
L'UD Agent n'exploite pas le Dual Core ou l'Hyper-Threading, d'où les 50%. Sur Boinc on est à 100% par défaut.
Plus on utilise un % élevé du processeur, et plus on fait avancer la recherche.
Avec Boinc 5.8.0, (version actuellement en développement) il sera possible de spécifier le pourcentage du processeur que l'on veut voir calculer.


c'est bon j'ai rejoint la team
par contre dites pas que ca ralentit pas le pc ce serait mentir :)
moi jm'en fous j'ai 2 cores mais bon faut bien donner de soit pour vaincre sputain de sida et tutti quanti  [:garphild]

Message cité 2 fois
Message édité par nantais le 27-12-2006 à 19:39:12
n°1683975
sol invict​us
Posté le 27-12-2006 à 20:32:47  profilanswer
 

salut ca y est j'ai rejoint la team par contre p'tite question mon pc tourne 24 sur 24 le logiciel ne se mets pas en veille ou quoi que ce sois,si je le laisse tourner il va fais son travail sans avoir besoin de moi?

n°1683976
nantais
Posté le 27-12-2006 à 20:51:04  profilanswer
 

moi j'aimerai savoir comment on peut le stopper par exemple quand j'ai besoin de toutes les ressources de mon proco

n°1683977
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 27-12-2006 à 20:56:10  profilanswer
 

Bienvenue aux nouveaux :bounce:
 
Merci Marc :jap:

n°1683979
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 27-12-2006 à 20:58:47  profilanswer
 

nantais a écrit :

c'est bon j'ai rejoint la team
par contre dites pas que ca ralentit pas le pc ce serait mentir :)
moi jm'en fous j'ai 2 cores mais bon faut bien donner de soit pour vaincre sputain de sida et tutti quanti  [:garphild]


 
En fait, ça ne ralentit pas le PC ;)
Dès que tu as besoin de ressources, elles sont immédiatement libérées par le projet. Cela peut occasionner une très légère perte de réactivité, mais personnellement, je ne suis jamais parvenu à la mesurer.
Sinon, il est vrai que le client reste en mémoire vive, et que sur des configs qui en ont peu, cela peut se ressentir :jap:

n°1683982
Black Hole​ Sun
Esprit chaotique
Posté le 27-12-2006 à 21:03:31  profilanswer
 

sol invictus a écrit :

salut ca y est j'ai rejoint la team par contre p'tite question mon pc tourne 24 sur 24 le logiciel ne se mets pas en veille ou quoi que ce sois,si je le laisse tourner il va fais son travail sans avoir besoin de moi?


 
Exactement :jap:
Le logiciel tourne en permanence tant que ta machine fonctionne, SANS que tu aies quoique ce soit à faire :jap:
 

nantais a écrit :

moi j'aimerai savoir comment on peut le stopper par exemple quand j'ai besoin de toutes les ressources de mon proco


 
Lorsque tu as besoin de toutes les ressources de ton processeur, le logiciel les libère automatiquement. Pour t'en convaincre, lance un test CPU (type sandra, occt ou n'importe quel autre qui va solliciter 100% de ton CPU) et si tu fais ctrl+alt+del pendant l'exécution, tu verras que ton logiciel de test occupe 100% cpu (enfin, 99% car il y en a toujours d'autres en arrière plan), et que le logiciel de calcul distribué lui n'occupe plus du tout de temps processeur.
 
Maintenant, si tu souhaites carrément l'arrêter malgré cela, il faudrait que tu patientes un petit peu que quelqu'un qui utilise ce logiciel te réponde (j'en utilise un autre pour d'autres projets)

n°1683996
Jean920
Posté le 27-12-2006 à 21:45:34  profilanswer
 

nantais a écrit :

c'est bon j'ai rejoint la team
par contre dites pas que ca ralentit pas le pc ce serait mentir :)
moi jm'en fous j'ai 2 cores mais bon faut bien donner de soit pour vaincre sputain de sida et tutti quanti  [:garphild]


 
Fais le test, essaye de lancer un programme, un montage vidéo qui prends beaucoup de la puissance du processeur. Tu verras le logiciel libère instantanément le processeur. Le logiciel utilise que la partie non exploité de ton processeur à chaque instant.
Si tu fais tourner un programme qui nécessite 100% du processeur, L'UD Agent sera à 0%
UN programme qui nécessite 80%, l'UD Agent sera à 20%
 
Par contre tu es sur le projet FightAids ou le projet Help Cure Muscular Dystrophy, ou les 2 en même temps ?
Si tu n'es que sur FightAids tu peux remplacer l'UD Agent par Boinc : http://forum.hardware.fr/hfr/Setie [...] 5813_1.htm
 
 

nantais a écrit :

moi j'aimerai savoir comment on peut le stopper par exemple quand j'ai besoin de toutes les ressources de mon proco


 
Pour stopper, tu as le petit logo WCG en bas à droite. Tu fais clic droit puis Exit. Ensuite tu redémarre le projet dans C:\Programs Files\WorldCommunityGrid\UD
C'est la solution la plus simple
 
Sinon il aussi aussi l'option Snooze. Petite Lune en bas à droite lorsque la fenêtre du projet est ouverte
 
http://www.boinc-af.org/images/Decrypthon/decr20.jpg
 
ça met en pause tout en gardant le programme ouvert pendant 5 minutes.
 
Tu peux programmer la durée de la pause dans les préférence (à gauche de la Lune, la case avec une croix)
Là tu as : Snooze sleeps for  ....  minutes , puis apply


Message édité par Jean920 le 27-12-2006 à 21:47:38
n°1684023
nantais
Posté le 27-12-2006 à 23:01:07  profilanswer
 

my device est a 146 :) jte bats jean920

n°1684037
otax
AF-LIBRISTES-JIP
Posté le 28-12-2006 à 00:00:37  profilanswer
 

OK c'est bien ... :jap:  
Mais si on a déjà Boinc qui tourne, est-ce que l'UD agent peut tourner ?
En d'autres termes s'ils ont des priorité différentes, un seul va tourner.
Et si elles sont égales çà fait quoi ? fifty-fifty ?

n°1684062
Jean920
Posté le 28-12-2006 à 00:42:06  profilanswer
 

Je sais pas si c'est très efficace de faire tourner les 2 plateformes en même temps, on doit certainement perdre de la puissance de calcul dans l'affaire.
Quand j'avais lancé l'UD Agent en même temps que Boinc, avec la même priorité basse
L'UD Agent prenait entre 16 et 24%
Et mes 2 unités Docking sous Boinc tournaient à environ 40%
 
Je préfère attendre que Help Cure Muscular Dystrophy arrive sur Boinc en Août 2007. Les 2 mois de la première phase vont passer très vite.
Pendant ce temps je fais tourner d'autres projets médicaux.


Message édité par Jean920 le 28-12-2006 à 00:46:30
n°1684073
redrackham
Posté le 28-12-2006 à 00:46:18  profilanswer
 

My Device est à 146 aussi : je crois qu'il n'est pas très  fiable la dessus car il ne reconnait pas les C2D est l'UD me donne le même score que pour un PIV 1.5GHz...

 

par contre comment on optimise ça sur bi-core?
UD seul = 50% des resource
UD plus un F@H et j'ai F@H=50% et UD = 30% (autre=1% idle = 19%)
peut on lancer deux UD?
il y a t il un "client" Multithread

 

Edition du 29/12/2006 à 01:00 :
pas compris pourquoi mais maintenant c'est parfait : F@H = 50% et wcgridHCMD.exe = 50%
le "score " du CPU a aussi été recalculé à 256
par contre le score Storage Performance est bidon, j'ai 20 (This Device 0.98GB)


Message édité par redrackham le 29-12-2006 à 01:08:42
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