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Auteur Sujet :

Rosetta - recherches sur la Mucoviscidose

n°1689640
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 10-01-2007 à 16:28:26  profilanswer
 

Reprise du message précédent :
Ce n'est pas la même (elle a été améliorée xD)


Message édité par popolito le 10-01-2007 à 16:32:45
mood
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Posté le 10-01-2007 à 16:28:26  profilanswer
 

n°1716715
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 16-03-2007 à 18:57:41  profilanswer
 
n°1719506
Jean920
Posté le 26-03-2007 à 22:49:58  profilanswer
 

Petit lexique des unités actuellement calculées sur Rosetta
 
Actuellement c'est essentiellement de la recherche sur l'ARN

n°1719690
power600
Schtroumpférateur grognon
Posté le 27-03-2007 à 11:52:39  profilanswer
 

http://img222.imageshack.us/img222/3474/sanstitrexo8.png
 
 :cry:  :cry:  :cry:


---------------
Schtrompférateur aigri blasé de la vie avec pas de sens de l'humour qui ferait du bien et avec pas de neurone qui marche sinon ça se saurait
n°1719770
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 27-03-2007 à 17:15:57  profilanswer
 

Prends les wus id et postes sur le message board (il y a un topic pour signaler les erreurs).

n°1720055
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 28-03-2007 à 18:58:16  profilanswer
 

L'AF a pris une place : http://www.boincsynergy.com/stats/ [...] roject=rah
Mais va en reperdre une d'ici quelques temps (regardez en bas de la page, le 1er rac qui est à la 83ème place à l'heure ou je vous parle, qui a recruté  presque 3000 personnes en 1 semaine et qui se fait du 300 000 crédits par jour).

n°1720363
power600
Schtroumpférateur grognon
Posté le 29-03-2007 à 23:46:28  profilanswer
 

popolito a écrit :

Prends les wus id et postes sur le message board (il y a un topic pour signaler les erreurs).


Le problème venait du Mac.
C'est que c'est pas aussi facile à utiliser que Windows ces machins là, j'ai du foutre les mains dans le cambouis pour réparer :o  :D


---------------
Schtrompférateur aigri blasé de la vie avec pas de sens de l'humour qui ferait du bien et avec pas de neurone qui marche sinon ça se saurait
n°1721654
titoune42
Aquaphile
Posté le 01-04-2007 à 23:38:05  profilanswer
 

Et hop je rejoins le projet.
Salut à tous :hello:


Message édité par titoune42 le 01-04-2007 à 23:38:14
n°1726217
jascooby
Cruncher bio :)
Posté le 13-04-2007 à 13:31:48  profilanswer
 

:hello:  
 
Ptites questions please :
 
- Rosetta crédite t'il un score prédéfini pour chaque WU calculée qque soit le temps de calcul un peu comme Seti ou se base t'il sur un archaïque systeme de benchs comme QMC par exemple ? (favorisant les cheaters)
 
- Les WU sont toutes assez longues ?  
 
- Ca a l'air de créditer assez peu ?
 
Merci  :jap:


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http://boinc.roadrunners.fr/signat [...] 323bcb.jpg
n°1726221
Jean920
Posté le 13-04-2007 à 13:36:31  profilanswer
 

jascooby a écrit :

:hello:  
 
Ptites questions please :
 
- Rosetta crédite t'il un score prédéfini pour chaque WU calculée qque soit le temps de calcul un peu comme Seti ou se base t'il sur un archaïque systeme de benchs comme QMC par exemple ? (favorisant les cheaters)


 
C'est un système de point fixe comme sur Seti
 

jascooby a écrit :


- Les WU sont toutes assez longues ?


 
C'est toi qui regle la durée d'une unité (tu peux aller de 1 à 24h/unité) : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ [...] et=project
Pour régler la durée d'une unité de calcul. Appuyer sur Edit Rosetta@home preferences. Target CPU run time. Choisir dans le menu déroulant la durée qui vous convient, ça va de 1 heure à 24h. Sauvegarder en appuyant sur Update preferences.
 

jascooby a écrit :


- Ca a l'air de créditer assez peu ?


 
Non en fait c'est assez proche des Points données par Seti sans les optis, et pareil que sur Climate
http://boinc.netsoft-online.com/e1 [...] t_cpcs.php
 
 

mood
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Posté le 13-04-2007 à 13:36:31  profilanswer
 

n°1726254
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 13-04-2007 à 13:51:49  profilanswer
 

Citation :

se base t'il sur un archaïque systeme de benchs comme QMC par exemple ?


QMC a corrigé son système de points (d'ailleurs, c'est assez drôle comment certaines teams ont vu leur rac se casser la gueule :D)
Pour rosetta, ce n'est pas encore tout à fait comme seti je crois, c'est un système assez compliqué, mais pas basé sur les benchs, donc pas de triche possible.
Sinon, comme l'a dit heyoka, ça crédite à peu près normalement : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_hosts.php


Message édité par popolito le 13-04-2007 à 13:53:32

---------------
http://www.boinc-af.org/
n°1726276
jascooby
Cruncher bio :)
Posté le 13-04-2007 à 14:03:43  profilanswer
 

Jean920 a écrit :

C'est un système de point fixe comme sur Seti
 
 
 
C'est toi qui regle la durée d'une unité (tu peux aller de 1 à 24h/unité) : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ [...] et=project
Pour régler la durée d'une unité de calcul. Appuyer sur Edit Rosetta@home preferences. Target CPU run time. Choisir dans le menu déroulant la durée qui vous convient, ça va de 1 heure à 24h. Sauvegarder en appuyant sur Update preferences.
 
 
 
Non en fait c'est assez proche des Points données par Seti sans les optis, et pareil que sur Climate
http://boinc.netsoft-online.com/e1 [...] t_cpcs.php


 
 :jap:  
 
Réponse nickel comme d'hab !  :jap:  
 


---------------
http://boinc.roadrunners.fr/signat [...] 323bcb.jpg
n°1732634
elbutor
Sic luceat lux
Posté le 26-04-2007 à 15:42:43  profilanswer
 

Count me in !

n°1733825
tompouce01
Tchip !
Posté le 30-04-2007 à 11:31:11  profilanswer
 

Salut tout le monde !!!
 
Venant de découvrir cette appli, je l'ai installé sur mes ordi et sur mon poste au boulot d'où une question naissante !!! :)
 
Mon accès au boulot est plutôt style sécurisé et tout et tout avec accès proxy etc etc
 
La question est que je ne voudrai pas créer une faille de sécurité ou un truc dans le genre... style que des personnes mal intentionnées puissent se servir de cette brèche pour pénétrer dans le réseau...
 
Plizzzee !!! Help a newbie !!! :d

n°1733888
Jean920
Posté le 30-04-2007 à 17:44:39  profilanswer
 

A ma connaissance, personne n'a jamais eu de problème

n°1734208
tompouce01
Tchip !
Posté le 01-05-2007 à 19:17:28  profilanswer
 

Merci pour l'info !!!

n°1735103
Jean920
Posté le 04-05-2007 à 13:10:44  profilanswer
 

Mise à jours du premier post avec une nouvelle recherche sur les maladies suivantes :
 
L'anémie de Fanconi  
La fibrose kystique (mucoviscidose)
L'hémopholie A  
X-SCID (immunodéficience sévère héréditaire liée au chromosome X)
ADA-SCID (déficit immunitaire combiné sévère par déficit en adénosine désaminase)
La tyrosinémie de type 1.
 
Voir ici pour plus de détails
 
Le but est de développer des vecteurs de thérapie génique qui viennent couper la partie des gènes responsables de ces maladies. La restriction proche d'une mutation entraine un mécanisme de recombinaison cellulaire.


Message édité par Jean920 le 04-05-2007 à 13:12:16
n°1743051
alto101
Posté le 04-06-2007 à 12:44:58  profilanswer
 

est-ce normal d'avoir une occupation du cpu en dent de scie (utilisation du cpu passant de 16 a 100 pourcent toute les 3-4 secondes)  en utilisant rosetta via boinc?
J'ai un prescott 3.2ghz.

n°1743080
Jean920
Posté le 04-06-2007 à 17:50:50  profilanswer
 

alto101 a écrit :

est-ce normal d'avoir une occupation du cpu en dent de scie (utilisation du cpu passant de 16 a 100 pourcent toute les 3-4 secondes)  en utilisant rosetta via boinc?
J'ai un prescott 3.2ghz.


 
Il faut enlever la limitation CPU
 
Vue simple  
Preferences
Ne pas utiliser plus de 100% du processeur
 
Et/ou directement ici :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ [...] set=global
 
Use at most
Enforced by version 5.6 and greater 100 percent of CPU time

n°1743082
alto101
Posté le 04-06-2007 à 18:03:19  profilanswer
 

J'attend de recevoir mon nouveau ventirad avant parce que avec le intel je suis déjà à 60°c sans trop forcer

n°1743101
Jean920
Posté le 04-06-2007 à 19:54:21  profilanswer
 

alto101 a écrit :

J'attend de recevoir mon nouveau ventirad avant parce que avec le intel je suis déjà à 60°c sans trop forcer


 
Oui donc dans ce cas c'est normal.
La limitation CPU est encore un peu basique. ça va surement s'améliorer avec le temps

n°1745800
alto101
Posté le 18-06-2007 à 14:46:09  profilanswer
 

Bon reçu ventirad et tout mais toujours a 60-62C°. Tant pis j'ai quand même mis rosetta à 100% on verra bien, c'est ptet la sonde thermique qui raconte n'importe quoi.
Sinon pour en revenir à rosetta, je voulais savoir qu'elle était la différence sur le principe entre rosetta et folding?

n°1745860
Jean920
Posté le 18-06-2007 à 21:58:39  profilanswer
 

alto101 a écrit :

Bon reçu ventirad et tout mais toujours a 60-62C°. Tant pis j'ai quand même mis rosetta à 100% on verra bien, c'est ptet la sonde thermique qui raconte n'importe quoi.


 
60-62° pour moi c'est normal. J'ais mon Pentium 4 depuis maintenant près de 3 ans qui fonctionne presque 24/24 et il y a toujours été dans ces températures là.
 

alto101 a écrit :


Sinon pour en revenir à rosetta, je voulais savoir qu'elle était la différence sur le principe entre rosetta et folding?


 
Le but est le même, par contre les méthodes et les applications diffèrent. C'est une saine concurrence de celui qui mettra au point l'application la plus performante
Après les protéines et donc les maladies étudiés sont différentes.
Il se peut au final qu'une application soit plus adapatée dans les recherches sur certaines maladies en particulier, dans ce cas les 2 applications seront utiles
Rosetta étudie aussi l'ARN alors que Folding n'a je crois pas encore commencé à plier de l'ARN


Message édité par Jean920 le 18-06-2007 à 22:00:24
n°1752556
alto101
Posté le 11-07-2007 à 00:47:02  profilanswer
 

Citation :

60-62° pour moi c'est normal. J'ais mon Pentium 4 depuis maintenant près de 3 ans qui fonctionne presque 24/24 et il y a toujours été dans ces températures là.


 
Ok très bien parce que je crois qu'on a  le même processeur d'après ma lecture du fil. De toute façon je pense que ma sonde thermique est défectueuse parce que maintenant avec un xp90c+ bonne pate thermique toujours la même temp donc bon... De toute façon peut importe tant qu'il est pas mort je m'en fout un peu.
Donc sinon je viens d'installer rosetta sur mon 2ème ordinateur 2.8ghz pentium C je crois qui d'après le benchmark de rosetta est plus puissant que celui sur lequel je suis en ce moment mais qui étonnement met beaucoup plus de temps par Wu. genre 5h et des poussières par wu avec 2 en même temps (Ht) tandis qu'avec celui ci je met 3h. Aurais tu une idée d'où  cette différence peut venir? sachant que les deux sont a 100% d'utilisation CPU (enfin dans les réglage boinc en tout cas, le 2.8ghz n'a pas l'air de respecter ça  quand je regarde l'occupation cpu avec le gestionnaire des taches windows).
Merci


Message édité par alto101 le 18-07-2007 à 15:58:18
n°1754168
alto101
Posté le 18-07-2007 à 15:58:00  profilanswer
 

Un petit up pour ma question :hello:

n°1754482
Jean920
Posté le 19-07-2007 à 19:00:25  profilanswer
 

Le 2,8 ghz utilise combien de % du processeur ?

n°1755553
alto101
Posté le 23-07-2007 à 22:29:59  profilanswer
 

Difficile à dire ça varie toutes les 5s environ entre 1% et a peu près 100%

n°1755831
power600
Schtroumpférateur grognon
Posté le 25-07-2007 à 01:12:58  profilanswer
 

A tout hasard, il chauffe pas trop? Ces proc ont une sécurité qui fait chuter la fréquence en cas de chauffe excessive.


---------------
Schtrompférateur aigri blasé de la vie avec pas de sens de l'humour qui ferait du bien et avec pas de neurone qui marche sinon ça se saurait
n°1756394
lalrobin
Posté le 27-07-2007 à 09:38:38  profilanswer
 

Bonjour,
 
j'avais deja utilisé BOINC par le passé, mais je viens de recommencer à l'utiliser depuis un bon mois. J'ai selectionné ce projet, car j'ai recherché avant tout des calculs distribué orienté vers les recherches contre les maladies en général.
 
Pour l'instant je n'offre qu'un modeste P4 2.8Ghz à la science et en plus il est partagé sur cinq projets, dont Rossetta. Ne recherchant pas le classement à tout prix, je n'ai pas du tout fait attention au mode de calcul du score.  :lol:  
 
Je pense changer en septembre pour un quad Q6600, sais tu si BOINC gère bien le Quad ou il faut faire des réglages particulier pour faire fonctionner les 4 coeurs ?

n°1756461
Jean920
Posté le 27-07-2007 à 15:00:47  profilanswer
 

lalrobin a écrit :


Je pense changer en septembre pour un quad Q6600, sais tu si BOINC gère bien le Quad ou il faut faire des réglages particulier pour faire fonctionner les 4 coeurs ?


 
Il y aucun problème Boinc fera calculer 4 unités en simultané. Il faudra juste faire attention à l'utilisation mémoire en fonction du projet choisie. Par exemple 4 unités Rosetta ça fait 4 x 100 Mo d'utilisé. Mais si tu as 2 Go de ram ça ne pose pas de problème
Par contre si tu choisie un projet comme Superlink@Technion ça fait tout suite 4 x 400 Mo.
 

alto101 a écrit :

Difficile à dire ça varie toutes les 5s environ entre 1% et a peu près 100%


 
Regarde si la limitation CPU n'est pas activée
Dans Vue simple
Preferences
ça doit être sur "Ne pas utiliser plus de 100% du processeur"

Message cité 1 fois
Message édité par Jean920 le 27-07-2007 à 15:05:39
n°1756462
lalrobin
Posté le 27-07-2007 à 15:12:18  profilanswer
 

Jean920 a écrit :


 
Il y aucun problème Boinc fera calculer 4 unités en simultané. Il faudra juste faire attention à l'utilisation mémoire en fonction du projet choisie. Par exemple 4 unités Rosetta ça fait 4 x 100 Mo d'utilisé. Mais si tu as 2 Go de ram ça ne pose pas de problème
Par contre si tu choisie un projet comme Superlink@Technion ça fait tout suite 4 x 400 Mo.
 


Merci de la réponse.
Je prévois 2 Go de RAM donc c'est tout bon.
 
Maintenant j'attends plus que les nouvelles carte mère à base de X38 pour me lancer dans le nouveau PC.

n°1756574
alto101
Posté le 27-07-2007 à 23:57:52  profilanswer
 

Merci pour vos réponse. Non il ne chauffe pas trop d'après Speedfan il ne dépasse pas les 45°c et la limitation n'est pas activé parceque il est sur les même préférence que mon p4 3.2ghz qui fonctionne normalement

n°1756576
Jean920
Posté le 28-07-2007 à 00:04:52  profilanswer
 

alto101 a écrit :

Merci pour vos réponse. Non il ne chauffe pas trop d'après Speedfan il ne dépasse pas les 45°c et la limitation n'est pas activé parceque il est sur les même préférence que mon p4 3.2ghz qui fonctionne normalement


 
Justement, les préférences de la Vue simple sont des préférences propre à l'ordinateur.
Avec l'option "je veux personnaliser mes préférences uniquement pour cet ordinateur."
D'après moi ça ne peux venir que de là


Message édité par Jean920 le 28-07-2007 à 00:05:02
n°1760843
cyber103
Où ca un litchi ?!
Posté le 19-08-2007 à 09:44:36  profilanswer
 

Un gros problème avec rosetta : au bout d'un moment, les 8/10 des unités se bloquent, l'occupation du proc tombe à 50% (bi-cpu), et impossible de relancer l'unité, obligé d'annuler le calcul... Je suis le seul dans ce cas ?

n°1760844
CorranHorn
0.300 GFlops/s
Posté le 19-08-2007 à 09:51:45  profilanswer
 

J'ai retiré rosetta des machines au boulot. J'avais toujours des problèmes sur les machines qui avaient ce projet.
 
J'avais les pcs qui ne faisaient plus rien au bout d'un moment. Donc maintenant j'évite ce projet :(

n°1762912
Astro 111
Red Orchestra 2 - Squad
Posté le 27-08-2007 à 13:43:30  profilanswer
 

Comment savoir sur quel projet Rosetta travail sur BOINC ?


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Alternatives à Facebook, Skype, ...  • En finir avec les rasoirs jetables
n°1829482
elbutor
Sic luceat lux
Posté le 09-02-2009 à 16:29:27  profilanswer
 

Au fait je me suis remis sur Rosetta :D

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