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  Projet français sur les Protéines (Ecole Polytechnique)

 


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Auteur Sujet :

Projet français sur les Protéines (Ecole Polytechnique)

n°1661145
Jean920
Posté le 04-10-2006 à 17:31:45  profilanswer
 

http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/images/cath0.gif Proteins@Home
 
 
URL du projet : http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/
Inscriptions
 
 
Article sur Boinc-AF
 
Le projet est dans la phase 2 de son alpha test

 
Projet de l'École Polytechnique
 
Documentation :
 
La séquence d'acides aminés d'une protéine détermine sa structure tri-dimensionnelle, ou 'repliement'. Inversement, le repliement est compatible avec un nombre grand mais limité de séquences.
Identifier ces séquences pour un repliement donné, c'est le 'problème inverse du repliement'. Nous sommes en train de le résoudre pour un grand nombre de repliements connus (un sous-ensemble représentatif, soit 1500 repliements). L'étape la plus coûteuse consiste à contruire les fonctions d'énergie décrivant chaque repliement. Pour chaque repliement, nous considérons toutes les séquences d'acides aminés possibles. Paradoxalement, c'est faisable du point de vue du temps de calcul, parce que nos fonctions d'énergie sont des 'fonctions de paires' (une somme d'interactions entre paires d'acides aminés). Les fonctions d'énergie construites, nous pouvons explorer l'espace des séquences possibles rapidement et efficacement, et retenir les plus favorables.
Cette 'cartographie' à grande échelle de l'espace des séquences de protéines aura des applications pour la prédiction de structures et fonctions de protéines, pour comprendre l'évolution des protéines, et pour concevoir de nouvelles protéines. En vous inscrivant, vous aiderez à construire les fonctions d'énergie et vous ferez avancer un problème important de biotechnologie. Pour plus d'informations, cf la documentation technique (pdf) ou contactez-nous par les Questions-réponses .
 
 
 
 
Une unité compte de 200 à 230 checkpoints. David le développeur du projet travaille sur des unités qui auraient toutes une durée comparable.  
L'application actuelle s'appelle pah_xplor 7.11
 
Ecran de Veille
http://archettes.chez-alice.fr/ecran.jpg
 
 
L'Alliance Francophone est pour le moment 3ème sur le projet
Il n'y a pas encore de stats internes à l'AF, que ce soit chez Oxxam, où chez JMB


Message édité par Jean920 le 18-10-2006 à 22:25:16
mood
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Posté le 04-10-2006 à 17:31:45  profilanswer
 

n°1661149
celtar
Certifié Cores@home à 93%
Posté le 04-10-2006 à 17:53:20  profilanswer
 

J'avais visité leur site mais je trouvais leur présentation assez sommaire... pas d'objectif clair pour moi
 
même si c'est un projet français cela fait un projet de plus pour le folding parmi beaucoup déjà
 
Enfin, à suivre...
Merci jean pour l'introduction


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Code Remise - Les Roadrunners
n°1661155
ichigo 109​0
Posté le 04-10-2006 à 18:13:39  profilanswer
 

Ca ne ressemble pas un peu à Rosetta?

n°1661162
Jean920
Posté le 04-10-2006 à 18:42:25  profilanswer
 

celtar a écrit :

J'avais visité leur site mais je trouvais leur présentation assez sommaire... pas d'objectif clair pour moi
 
même si c'est un projet français cela fait un projet de plus pour le folding parmi beaucoup déjà
 
Enfin, à suivre...
Merci jean pour l'introduction


 
C'est surement dû au fait que le projet n'est qu'en alpha test, je pense qu'on verra mieux apparaitre les objectifs quand le projet sera en beta test.
De toute façon, tout le monde peut poser ses questions en français sur le message board du projet. Les gens de polytechnique qui s'occupent du proteins@Home ont l'air d'être à l'écoute et ils répondent assez rapidement aux questions.
Donc pour avoir des éclaircissement il suffit de poser la question sur leur forum.
 

Citation :

Ca ne ressemble pas un peu à Rosetta?


 
Oui sauf que c'est français, peut-être que certaines personnes qui ne sont pas prêtent à participer à des projets américains et qui pour certaines d'entre elles nous ressortent des thèses farfelues de complot, genre je veux pas travailler pour le calcul de trajectoire des missiles américains. Pour un projet français là ils ont plus cette excuse bidon. :lol:  
 
Les 2 projets se ressemblent, cependant il y a tellement de choses à calculer dans le domaine du repliement des protéines que un seul projet ne pourrait jamais y venir à bout, il faut mieux se partager le travail entre plusieurs groupes de recherche.
Puisque derrière le calcul il a tout un travail effectué par les chercheurs pour mettre en place de nouvelles unités à calculer et ensuite pour analyser les résultats fournies par ces unités calculées et améliorer l'application et les méthodes de repliement des protéines.
Et de toute façon comme les résultats des projets sont rendus publics chacun de ces groupes peuvent se tenir au courant des avancés des autres et ainsi améliorer leurs propres recherches ou se spécialiser sur des protéines non encore étudiées

Message cité 1 fois
Message édité par Jean920 le 04-10-2006 à 18:45:24
n°1661164
ichigo 109​0
Posté le 04-10-2006 à 18:49:24  profilanswer
 

Jean920 a écrit :

Oui sauf que c'est français, peut-être que certaines personnes qui ne sont pas prêtent à participer à des projets américains et qui pour certaines d'entre elles nous ressortent des thèses farfelues de complot, genre je veux pas travailler pour le calcul de trajectoire des missiles américains. Pour un projet français là ils ont plus cette excuse bidon. :lol:


 
Nan ? Tu ne vas pas me dire qu'il y a des gens qui pensent à ça quand même? [:rofl]

n°1661174
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 04-10-2006 à 19:28:57  profilanswer
 

Si si, seti par exemple est un projet espion je ne sais trop quoi (déjà entendu).

n°1661195
Jean920
Posté le 04-10-2006 à 20:23:34  profilanswer
 

ichigo 1090 a écrit :

Nan ? Tu ne vas pas me dire qu'il y a des gens qui pensent à ça quand même? [:rofl]


 
Récement dans les commentaires de la news de PcInpact sur l'utilisation des GPU pour Folding
 
Ecrit par jouet le 02/10/2006 à 21:55:21 :
 

Citation :

allez on aide tous l'armée americaine a calculer ses trajectoires de missile et que ca saute


 
http://www.pcinpact.com/actu/news/ [...] 41#c858041
 
Je suppose aussi que selon lui Folding a servis à guider les Boieng dans le WTC et le Pentagone
 
 :D


Message édité par Jean920 le 04-10-2006 à 20:25:03
n°1661218
laxou
bof bof ...
Posté le 04-10-2006 à 21:22:36  profilanswer
 

est ce que quelcun a un code invité pour moi ?


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n°1661230
Jean920
Posté le 04-10-2006 à 21:43:58  profilanswer
 

Regarde là : Article sur Boinc-AF
 
Par contre je sais pas si il marche encore


Message édité par Jean920 le 04-10-2006 à 21:44:25
n°1661231
laxou
bof bof ...
Posté le 04-10-2006 à 21:49:53  profilanswer
 

a marche !


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mood
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Posté le 04-10-2006 à 21:49:53  profilanswer
 

n°1664138
jump400
Posté le 16-10-2006 à 13:27:42  profilanswer
 

L'AF vient de passer en 4ème position  :bounce:

n°1664141
laxou
bof bof ...
Posté le 16-10-2006 à 13:28:49  profilanswer
 

je vien de mettre mon x2 dessus pour voir ce que ca donne :bounce:

n°1664192
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 16-10-2006 à 16:38:33  profilanswer
 

Au passage, pour ceux qui remettent en doute le but du projet ("c'est un projet comme les autres sur les protéines" ), voici un petit pdf qui explique tout :
http://bioc.polytechnique.fr/bioco [...] AThome.pdf
Donc, attachez-vous !!! :D

n°1664303
tristanf
RIP Rostro
Posté le 16-10-2006 à 19:07:50  profilanswer
 

quand j'ai 5 minutes à moi, je jette un coup d'oeil a ce pdf et au projet :)


---------------
Fumer tue. Ouais. Vivre aussi
n°1664400
celtar
Certifié Cores@home à 93%
Posté le 16-10-2006 à 23:13:59  profilanswer
 

très intéressant ce document
 
merci


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Code Remise - Les Roadrunners
n°1665059
maveryck
Posté le 18-10-2006 à 22:14:44  profilanswer
 

Projet rejoint ;)

n°1665804
jump400
Posté le 20-10-2006 à 23:42:45  profilanswer
 

Bonne nouvelle, les stats XML sont enfin dispos sur  
http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/stats/
 
Ont devrait avoir rapidement des stats sur BoinSynergy, free-dc, boincstats et nos  jmb, oxxam etc... bien sur !
 
 :bounce:  
 
Ca arrive juste au bon moment, car l'AF est 2ème depuis cet apre'm et devrait être 1ère dans les prochaines heures !


Message édité par jump400 le 20-10-2006 à 23:46:51

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Tous les Users of the Day ici
n°1668022
tristanf
RIP Rostro
Posté le 31-10-2006 à 11:42:41  profilanswer
 

petite question, il y a besoin apparemment d'un code invité pour s'inscrire, on en obtient un comment ?


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Fumer tue. Ouais. Vivre aussi
n°1668186
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 31-10-2006 à 18:11:42  profilanswer
 

Il est là ==> ze12hj68

n°1668191
tristanf
RIP Rostro
Posté le 31-10-2006 à 18:26:33  profilanswer
 

merci :)


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Fumer tue. Ouais. Vivre aussi
n°1668299
Jean920
Posté le 31-10-2006 à 23:33:42  profilanswer
 

2 jours de suite Uotd sur Proteins@Home http://forum-images.hardware.fr/images/perso/mrbrelle.gif
 
http://www.myboinc.com/GetUOTD.php [...] l&sort=prj

n°1669157
laxou
bof bof ...
Posté le 03-11-2006 à 13:52:27  profilanswer
 

laxou a écrit :

je vien de mettre mon x2 dessus pour voir ce que ca donne :bounce:


 :ouch:  :ouch:  :ouch: il est 2e au rac !  :ouch:  :ouch:  :ouch:


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n°1670203
Ttienne
C'est pas pour me vanter, mais
Posté le 07-11-2006 à 23:13:05  profilanswer
 

up :o


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Y a de la bière, sur Véga, hein ? Si y'en a pas, on y va pas ! Et pis c'est tout ! :P | Vds hdd ide
n°1670583
laxou
bof bof ...
Posté le 09-11-2006 à 15:05:43  profilanswer
 

On commence les oupsages ? [:jocev]
20.000


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n°1670894
joss beaum​ont
Amour, Gloire et Beauté
Posté le 10-11-2006 à 19:29:02  profilanswer
 

ayyyyyyyyyyyyyééééé !
 
j'y suis aussi !  [:atahonfl]  
 
par contre les premières unités de calcul téléchargées sont très petites : boinc m'affiche 44 min de calcul en moyenne par unité alors que les unités de wcg par exemple sont affichées à 5h00 !


---------------

n°1671045
laxou
bof bof ...
Posté le 11-11-2006 à 12:55:40  profilanswer
 

ayé j ai 1000 en rac  [:volta]


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n°1671955
Orbitax
May The Troll Be In You ©
Posté le 15-11-2006 à 19:01:21  profilanswer
 

Ya pos grand monde, je vait me rajouter pour un projet qui vaut le coup :D
Ayé, je m'y suis collé  :D


Message édité par Orbitax le 15-11-2006 à 19:12:03
n°1671961
Ttienne
C'est pas pour me vanter, mais
Posté le 15-11-2006 à 19:19:50  profilanswer
 

[:chapi-chapo]


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Y a de la bière, sur Véga, hein ? Si y'en a pas, on y va pas ! Et pis c'est tout ! :P | Vds hdd ide
n°1675714
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 29-11-2006 à 16:43:50  profilanswer
 

La création de comptes est possible sans mot de passe maintenant (passage en beta).
http://biology.polytechnique.fr/pr [...] ?teamid=31


Message édité par popolito le 29-11-2006 à 16:54:19
n°1675715
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 29-11-2006 à 16:45:31  profilanswer
 

Pis une belle description en anglais : http://biology.polytechnique.fr/pr [...] ation2.php :)

n°1675719
Orbitax
May The Troll Be In You ©
Posté le 29-11-2006 à 17:06:06  profilanswer
 

Credit total 1,514.61
Credit moyen 86.00
 
Ca monte doucement :D

n°1675768
laxou
bof bof ...
Posté le 29-11-2006 à 22:10:09  profilanswer
 

Credit total 38,613.05
Credit moyen 960.96
 
j ai eu une grosse chute de rac apres une coupure de courrant : les wus ont ete pourries et 2 pc ont taffé pendant 3 jours et n ont pas avancé d un poil de cul ... j ai du reseter le projet sur les 2 pc pour que ca redemarre :(


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n°1675770
Ttienne
C'est pas pour me vanter, mais
Posté le 29-11-2006 à 22:25:25  profilanswer
 

sinon, ca a l'air de créditer pas mal, votre truc, là :D

n°1675771
laxou
bof bof ...
Posté le 29-11-2006 à 22:28:55  profilanswer
 

moins qu einstein je crois


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Keep cool, have fun. Always. | in :o i trust
n°1676552
Jean920
Posté le 01-12-2006 à 21:27:07  profilanswer
 

Comme l'a dit popolito, le projet vient dejà de passer en beta test, ça avance à un bon rythme.
Y a du savoir faire à Polytechnique  :jap:


Message édité par Jean920 le 01-12-2006 à 21:28:35
n°1788832
popolito
http://www.boinc-af.org/
Posté le 29-01-2008 à 18:12:44  profilanswer
 

Blague du jour :
Ici même.


Message édité par popolito le 29-01-2008 à 18:13:03
n°1795844
cotmar
Posté le 23-02-2008 à 11:23:21  profilanswer
 

Bonjour,
 
Je ne reçois plus rien depuis plusieurs mois de ce projet ? Est-ce que c'est normal ?  
 
A très bientôt.
 
Marco.


---------------
Marco
n°1795845
alipse
Gallinacé Traceur
Posté le 23-02-2008 à 11:28:34  profilanswer
 

Salut,
 
le projet vient de reprendre, j'ai en ce moment même du travail.
 
Donc si tu n'arrives pas a avoir du travail, peut-être qu'il faudra te détacher, rattacher au projet.
 
:hello:


---------------
On The Road Right now :-)
n°1795850
cotmar
Posté le 23-02-2008 à 11:51:48  profilanswer
 

Bonjour Alipse,
 
Merci beaucoup pour ta réponse.
En fait je viens de m'appercevoir qu'en effet j'avais juste reçu un nouveau boulot de la part de proteines@homes... J'avaus as vu... Mais bon j'avoue que de temps en temps je le confond un peut avaec Predictor.  :pt1cable:  
 
Ceci dit, au millieu de 14 projets parfois on s'y perd un peut. ;)
 
A bientôt et bonjour au coyotte.  :jap:  
 
Marco.

n°1835245
Methos
Posté le 25-05-2009 à 17:07:25  profilanswer
 

Bonjour,
Quelqu'un a des nouvelles du projet ?
Est-il terminé ? Il n'envoie plus de travail on dirait.

mood
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Posté le   profilanswer
 

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