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  [PHP] Histogramme en php

 


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[PHP] Histogramme en php

n°1718607
Cachouguin​teur
Yippie ki yay
Posté le 16-04-2008 à 14:39:03  profilanswer
 

Bonjour, je dois réaliser un projet pour un  cours à la fac. J'aurais aimé savoir si vous pourriez m'aider car j'ai du mal à tracer des histogrammes.
En fait, il faudrait que mon script fasse la chose suivante : l'utilisateur rentre une séquence d'ADN, c'est à dire une succession de lettre ATCGAATTCCGG... Ensuite cette séquence est découpée en groupe de 3 lettres (ATC, GAA,...) et donc en suivant le code génétique, cela est traduit en acides aminés (ATC donne I (isoleucine), GAA donne E (acide glutamique)... j'ai donc réalisé un script qui permet cela, c à d de traduire la séquence rentrée par l'utilisateur.
 
Mais après ça se complique : plusieurs bouts de 3 lettres (ou codons) peuvent coder pour le même acide aminé : exemple l'alanine est codé par GCT, GCC, GCA, GCG.  
 
Mon programme cherche donc à savoir si certains bouts de 3 lettres étaient plus fréquents que d'autres pour coder le même acide aminé. C'est là que j'ai besoin d'aide, je voudrais créer des histogrammes de façon dynamique en fonction de la séquence rentrée par l'utilisateur et avoir un histogramme pour chaque acide aminé. PAr exemple un histogramme pour l'alanine avec 4 barres GCT, GCC, GCA, GCG et avec le nombre à chaque fois que ces codons reviennent dans la séquence soumise par l'utilisateur.

mood
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Posté le 16-04-2008 à 14:39:03  profilanswer
 

n°1718612
Melendril
Posté le 16-04-2008 à 14:47:15  profilanswer
 

Salut,
 
Google est ton ami, tu trouvera facilement des librairies pour faire des graphiques en PHP. Ex : http://www.aditus.nu/jpgraph/features.php

n°1718626
Cachouguin​teur
Yippie ki yay
Posté le 16-04-2008 à 15:10:04  profilanswer
 

ben mon souci c'est que je dois réaliser cela avec la librairie gd (celle que j'ai à ma fac)

n°1718629
tostiere
Posté le 16-04-2008 à 15:12:09  profilanswer
 

Un petit tuto pour utiliser GD et faire des graphiques :
http://www.siteduzero.com/tuto-3-1 [...] n-php.html

n°1718660
rufo
Pas me confondre avec Lycos!
Posté le 16-04-2008 à 16:59:07  profilanswer
 

sinon, y'a la lib GPl artichow ;)
 
http://www.artichow.org/


---------------
Astres, outil de help-desk GPL : http://sourceforge.net/projects/astres, ICARE, gestion de conf : http://sourceforge.net/projects/icare, Outil Planeta Calandreta : https://framalibre.org/content/planeta-calandreta
n°1718785
Cachouguin​teur
Yippie ki yay
Posté le 16-04-2008 à 19:54:39  profilanswer
 

ben j'ai déjà mes résultats en pourcentages sous forme de texte, mais mon souci vient de l'intégration des variables dans l'histogramme


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