J'avais eu un problème similaire, qui était causé par un secteur corrompu et non détecté par Windows.
Normalement, quand un secteur devient défaillant, son accès est aussitôt bloqué et non accessible.
Quand ce n'est pas détecté, windows tente d'y accéder, et le disque dur "freeze" (Il n'envoie plus aucune donnée à Windows, qui ne réagit plus lui non plus).
J'ai résolu ce problème avec HDD REGENERATOR sur une clé USB, et en bootant dessus. Une fois le disque analysé, il m'à trouvé plusieurs secteurs défaillants, il les à marqués en tant que tel, et depuis plus aucun problème de freeze.
Essaye, on ne sais jamais, mais ton problème me rappelle grandement le mien.