Bonjour à tous,
 
Nous voici donc à la recherche d'un bio-informaticien.    
Le poste est à pourvoir immédiatement.
 
La description du poste suit :
 
 
 
Bio-informaticien
 
Type de contrat : CDI
 
Ville: LYON
 
Laboratoire: VIROSCAN3D, PME
 
Nom du contact: Catherine Legras-Lachuer, CEO ViroScan3D
 
Email du contact: catherine.lachuer@viroscan3d.com
Date de validité: 01/10/2014
 
 
 
Description du poste:
 
Viroscan3D ( http://www.viroscan3d.com/ ) est une jeune société innovante proposant des prestations de service et de R&D de génomique en infectiologie (recherche de pathogènes, identification de bio-marqueurs) à l’aide de technologies haut débit (séquençage nouvelle génération, microarrays).  
Son activité est adossée à la plateforme de génomique Profilexpert de l’Université Lyon1.
 
Viroscan3D recrute un bio-informaticien qui sera chargé de l’analyse de données issues du séquençage NGS et de microarrays dans le cadre des projets de prestation de services de  la société.  
 
Mission:
 
Dans le cadre de votre activité au sein de la société vous serez impliqué dans :
 
- Le contrôle de la qualité des données obtenues ainsi que la rédaction du rapport qualité.
- La réalisation des analyses bio-informatiques des données moléculaires issues de technologies de génomique (séquençage nouvelle génération, microarrays).  
Vous serez notamment amené à réaliser des analyses de transcriptome), génotypage (CGH, altération moléculaires diverses), épigénome (méthylation de l’ADN, ChIP-seq, MiRNome, ChIP-on-chip, RRBS…), métagénomique (microbiomes (amplicons 16S, viromes) ainsi que des assemblages de séquences (séquençage De novo ou re-séquençage).  
 
- La rédaction du rendu de résultats des analyses réalisées.
- La  veille scientifique afin de participer à la définition des stratégies d’analyse, de développement et d’évolution de l’activité au sein de la société.
- La gestion du parc informatique.
 
Pour cela vous serez amené à :
 
- Utiliser des logiciels d’analyse commerciaux d’extraction de données issues du séquençage NGS associés à la technologie Illumina et des puces à ADN associé à la technologie Affymetrix et Illumina ou d’analyse tels que Ingenuity Pathway Analysis ou Partek, Galaxy, baseSpace.
- Définir les solutions analytiques à mettre en place pour répondre aux problématiques des  clients et effectuer des développements (programmation) le cas échéant.
- Créer et interroger des bases de données.
 
 
Profil:
 
Compétences
- Niveau Bac+5 en bio-informatique de formation universitaire ou équivalente. Une expérience antérieure en génomique et plus particulièrement en analyse NGS est un plus.  
- Les formations Bac+3 avec une expérience significative (3 ans minimum) en analyse NGS seront considérées.  
- Maitrise de plusieurs langages de développement et programmation parmi R, Java, Perl (CGI, perl objet), PHP, Html, Javascript, C++, Python, Shell…
- Connaissance des algorithmes pour l’analyse des données Illumina (CASAVA, TopHat, Bowtie etc..) est un plus.
- Compétences de gestion, développement et intégration de base de données relationnelles de type SQL
- Des bases en biologie moléculaire (concepts à la base du transcriptome, du génome et de l’épigénome, séquences et structure des gènes, , bases de données ENSEMBL, NCBI, UCSC, UNIPROT etc..) sont fortement appréciées. Notion en infectiologie sera un plus.
- Des connaissances en statistiques sont un plus.
- Communication écrite et orale, anglais nécessaires
Qualités personnelles
- Autonomie, rigueur, sens de l’organisation et capacité à s’investir dans une équipe, un projet,  
- Sens de la communication et du relationnel, capacité à travailler en équipe,  
- Interaction multidisciplinaire  
 
 
Informations contractuelles:
 
CDI. Début : dès que possible.
Rémunération selon profil et expérience  
 
 
Avantages sociaux:
 
Forfait transport, tickets repas,
Complémentaire santé, plan de prévoyance, retraite complémentaire
 
Contact :
Envoyer CV et lettre de motivation à  en mentionnant la référence suivante «IBI 140613» en l’objet du mail à catherine.lachuer@viroscan3d.com.