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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°47169600
Rasthor
Posté le 23-09-2016 à 11:45:18  profilanswer
 

Reprise du message précédent :
http://www.nature.com/naturejobs/s [...] j7621-573a
 

Citation :

Salaries: Reality check
 
A feeling that good performance is not adequately rewarded is pervading the research world.


 
Pour une fois la France en première place d'un classement dans un article scientifique, avec 86%.... mais pas sur que ce soit positif....  :whistle:  
 
http://reho.st/self/5d74212773027e [...] 05dfa1.jpg  
 
Et sinon:
 

Citation :

Yet second thoughts about science seem to be commonplace across the world. About two in every ten respondents would not recommend research as a career path. That includes Birgit Rommel, a geneticist at the University of Bremen in Germany. She says she feels lucky to have a permanent job in academia, but wouldn't encourage others to follow in her footsteps. Jobs are too scarce, she says, and the system isn't geared to encourage success. “Germany has a stupid rule that you can work for only 12 years in academia without a permanent job, which kicks a lot of people out of the system,” she says. “Many people who wanted to do research end up as salespeople at some company.”

mood
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Posté le 23-09-2016 à 11:45:18  profilanswer
 

n°47169755
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 23-09-2016 à 11:52:38  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

http://www.nature.com/naturejobs/s [...] j7621-573a
 

Citation :

Salaries: Reality check
 
A feeling that good performance is not adequately rewarded is pervading the research world.


 
Pour une fois la France en première place d'un classement dans un article scientifique, avec 86%.... mais pas sur que ce soit positif....  :whistle:


 
Les 14% restants amha ils boivent leur alcool technique [:transparency]

n°47172372
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 23-09-2016 à 14:55:34  profilanswer
 

Alors Rasthor, au risque de te choquer je remets le salaire d'embauche dans la recherche en France (CNRS, INSERM, INRA).
 
1748 euros nets en CR2 (debut de carriere).
 
Oui oui tu lis bien.
 
Evidemment avant impot sur le revenu.
 
http://i.giphy.com/26FPLMDDN5fJCir0A.gif

n°47172404
Rasthor
Posté le 23-09-2016 à 14:57:52  profilanswer
 

RykM a écrit :

Alors Rasthor, au risque de te choquer je remets le salaire d'embauche dans la recherche en France (CNRS, INSERM, INRA).
 
1748 euros nets en CR2 (debut de carriere).
 
Oui oui tu lis bien.
 
Evidemment avant impot sur le revenu.


Non, mais je connais bien les salaires FR. :o

n°47177598
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 23-09-2016 à 22:29:11  profilanswer
 

RykM a écrit :

Alors Rasthor, au risque de te choquer je remets le salaire d'embauche dans la recherche en France (CNRS, INSERM, INRA).
 
1748 euros nets en CR2 (debut de carriere).
 
Oui oui tu lis bien.
 
Evidemment avant impot sur le revenu.
 
http://i.giphy.com/26FPLMDDN5fJCir0A.gif


salauds de riches enfermés dans leur tour d'ivoire


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°47187677
Oceanborn
Posté le 25-09-2016 à 14:57:19  profilanswer
 

Rasthor, ça se passe comment ta reconversion vers le privé? :o

n°47188336
Rasthor
Posté le 25-09-2016 à 16:34:47  profilanswer
 

Oceanborn a écrit :

Rasthor, ça se passe comment ta reconversion vers le privé? :o


RAS pour le moment. :/
 
Edit: j'avais eu deux entretiens telephonique y'a un an, c'etait la cata. :D
 
Le premier, le poste n'avait pas l'air tres existant et pas genial niveau perspective de carriere.
 
Le deuxieme, j'ai eu droit a trois quesions:
 
1) Etes vous bioinformaticien plutot biologique ou plutot statistique ? Plutot biol
2) Avez-vous une expérience dans l'industriel ? Nope.
3) Que connaissez vous sur le cancer ? Pas grand chose.
 
Merci, on vous recontactera dans une semaine. :o
 
Ces dernieres semaines, je me remets a jour dans le truc qu'ils appelent "Data science". En gros, j'essaie de mettre mes donnees dans MySQL, et gerer le tout avec des trucs """trendy""" comme Python, Pandas, Jupyer, Matplotlib.
 
 
Edit2: Mais ca m'emmerde quand meme de laisser tomber l'academique, j'ai quand meme une bonne liste de publications avec le recul.  [:zest:1]


Message édité par Rasthor le 25-09-2016 à 23:31:57
n°47267273
Rasthor
Posté le 03-10-2016 à 10:33:22  profilanswer
 

Des paris pour les prix Nobels de Medecine, Chimie et Physique ?

Message cité 1 fois
Message édité par Rasthor le 03-10-2016 à 10:34:02
n°47267578
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 03-10-2016 à 10:56:22  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Des paris pour les prix Nobels de Medecine, Chimie et Physique ?


 
Doudna/Charpentier ça me semble très probable, reste à savoir si elles auront le prix de médecine ou de chimie. Peut-être plutôt médecine.
Dans ce cas le prix de chimie risque d'aller à un "vrai chimiste" et je n'ai aucune idée des prétendants.

n°47267720
Rasthor
Posté le 03-10-2016 à 11:06:13  profilanswer
 

epsiloneridani a écrit :

Doudna/Charpentier ça me semble très probable, reste à savoir si elles auront le prix de médecine ou de chimie. Peut-être plutôt médecine.
Dans ce cas le prix de chimie risque d'aller à un "vrai chimiste" et je n'ai aucune idée des prétendants.


 
Ca me semble un peu tot, non ? :??:

mood
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Posté le 03-10-2016 à 11:06:13  profilanswer
 

n°47267802
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 03-10-2016 à 11:11:54  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


 
Ca me semble un peu tot, non ? :??:


 
Pour moi c'est mur, surtout si c'est le prix de chimie qui est en général plus réactif que les deux autres et qui récompense souvent des travaux au bout de 5 ans. Ok, là ça fait 4 mais ce sont des travaux plus importants que la moyenne des Nobel.
 
Quitte à refaire une deuxième fournée dans dix ans pour récompenser les meilleures applications.

n°47267809
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 03-10-2016 à 11:12:19  profilanswer
 

Non moi aussi Doudna Charpentier sans hésiter.  [:cosmoschtroumpf]  
 
Et l'année prochaine Rasthor  :jap:

Message cité 1 fois
Message édité par RykM le 03-10-2016 à 11:13:13
n°47267951
Rasthor
Posté le 03-10-2016 à 11:21:06  profilanswer
 

epsiloneridani a écrit :


 
Pour moi c'est mur, surtout si c'est le prix de chimie qui est en général plus réactif que les deux autres et qui récompense souvent des travaux au bout de 5 ans. Ok, là ça fait 4 mais ce sont des travaux plus importants que la moyenne des Nobel.
 
Quitte à refaire une deuxième fournée dans dix ans pour récompenser les meilleures applications.


Ok, merci. :jap:
 

RykM a écrit :

Non moi aussi Doudna Charpentier sans hésiter.  [:cosmoschtroumpf]  
 
Et l'année prochaine Rasthor  :jap:


 
2020 je vise.  [:nozdormu]

n°47268025
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 03-10-2016 à 11:24:42  profilanswer
 

Y'a le countdown sur le site  :lol:

n°47268029
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 03-10-2016 à 11:24:52  profilanswer
 
n°47268142
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 03-10-2016 à 11:30:35  profilanswer
 

C'est bizarre, mon téléphone n'a pas sonné quand le compte à rebours est arrivé à zéro ? [:transparency]

n°47268254
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 03-10-2016 à 11:37:29  profilanswer
 

The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2016 was awarded to Yoshinori Ohsumi "for his discoveries of mechanisms for autophagy".
 
Pour le coup je pensais que c'était trop tôt pour ce sujet !

n°47271626
_tchip_
Posté le 03-10-2016 à 16:11:56  profilanswer
 

j'aime le petit côté "leur réaction va vous surprendre" dans les interviews du site :o


Message édité par _tchip_ le 03-10-2016 à 16:12:07

---------------
J'adore la France, dans 20-30 ans y en aura plus.
n°47273121
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 03-10-2016 à 18:40:36  profilanswer
 

:hello: ptites questions pendant que je parcours tranquillement "Campbell Biology".

 

- Lors de la transcription, ils disent que c'est chaque fois le même "template strand" qui est utilisé pour un gène donné. Qu'est-ce qui fait que ça soit le cas ?
- Deuxième question (dont j'aurai peut-être la réponse plus loin lors de ma lecture mais que j'ai quand même envie de savoir), qu'est-ce qui régule le fait qu'un tel gène soit transcrit (je suppose, peut-être à tort, que ce n'est pas l'anarchie dans la cellule à ce niveau là) ?

 

Meurchi  :D

Message cité 2 fois
Message édité par bomberm4n le 03-10-2016 à 18:41:33

---------------
graaah !
n°47273186
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 03-10-2016 à 18:48:24  profilanswer
 

bomberm4n a écrit :

:hello: ptites questions pendant que je parcours tranquillement "Campbell Biology".
 
- Lors de la transcription, ils disent que c'est chaque fois le même "template strand" qui est utilisé pour un gène donné. Qu'est-ce qui fait que ça soit le cas ?
- Deuxième question (dont j'aurai peut-être la réponse plus loin lors de ma lecture mais que j'ai quand même envie de savoir), qu'est-ce qui régule le fait qu'un tel gène soit transcrit (je suppose, peut-être à tort, que ce n'est pas l'anarchie dans la cellule à ce niveau là) ?
 
Meurchi  :D


 
Dans le détail c'est très complexe mais pour faire simple, il y a des séquences dans l'ADN qui permettent de recruter la RNA polymérase II et d'initer ainsi la transcription. L'élément de séquence le plus important est la TATA box. Ces séquences ne sont pas pas palyndromiques et elles ne marchent donc que dans un sens, seul un des deux brins est donc transcrit.

n°47273291
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 03-10-2016 à 19:01:02  profilanswer
 

Thx, donc le fait qu'on utilise toujours le template strand et pas le coding tient au fait que c'est juste pour le premier des deux qu'on a la séquence qu'il faut pour initier le truc dans le sens qui va bien ?

 

Et du coup, c'est peut-être trop complexe pour faire simple comme tu dis, mais qu'est ce qui fait que la RNA poly va (1) s'activer et (2) qu'elle soit au bon gène qu'on veut ?

Message cité 1 fois
Message édité par bomberm4n le 03-10-2016 à 19:08:15

---------------
graaah !
n°47273408
Rasthor
Posté le 03-10-2016 à 19:13:00  profilanswer
 

bomberm4n a écrit :

:hello: ptites questions pendant que je parcours tranquillement "Campbell Biology".

 

- Lors de la transcription, ils disent que c'est chaque fois le même "template strand" qui est utilisé pour un gène donné. Qu'est-ce qui fait que ça soit le cas ?
- Deuxième question (dont j'aurai peut-être la réponse plus loin lors de ma lecture mais que j'ai quand même envie de savoir), qu'est-ce qui régule le fait qu'un tel gène soit transcrit (je suppose, peut-être à tort, que ce n'est pas l'anarchie dans la cellule à ce niveau là) ?

 

Meurchi  :D


Il y a des facteurs de transcriptions qui vont se lier a l'ADN et démarrer la transcription du gène cible. Ces facteurs de transcriptions lisent certains morceaux d'ADN très spécifiques.

 

Il y a par exemple les récepteurs nucléaires. Ces récepteurs nucléaires sont en deux parties: une partie (poche) qui va reconnaître un ligand (une molécule comme la vitamine A ou des steroides, par exemple) et un autre partie qui se fixe a l'ADN. Ils sont normalement inactifs, mais des qu'ils reconnaissent le ligand, ils deviennent actifs et vont se lier a l'ADN et démarrer la transcription (recrutement de RNA Pol II et tout le bazar), qui va produire l'ARN. Cet ARN peut ensuite servir de schéma pour produire des protéines (ARN messager), mais ce n'est pas une obligation dans le cadre de l'ARN non-codant.


Message édité par Rasthor le 03-10-2016 à 19:14:57
n°47273527
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 03-10-2016 à 19:27:17  profilanswer
 

bomberm4n a écrit :

Thx, donc le fait qu'on utilise toujours le template strand et pas le coding tient au fait que c'est juste pour le premier des deux qu'on a la séquence qu'il faut pour initier le truc dans le sens qui va bien ?
 
Et du coup, c'est peut-être trop complexe pour faire simple comme tu dis, mais qu'est ce qui fait que la RNA poly va (1) s'activer et (2) qu'elle soit au bon gène qu'on veut ?


 
Ca fait intervenir des facteurs de transcription, des protéines régulatrices capables capables re connaitre des séquences particulières en amont de la TATA box. Chaque facteur de transcription est ainsi capable de reconnaitre un certain nombre de gènes. Par exemple des facteurs de transcription spécialisés dans la réponse immune vont être activés quand une infection est détectée et ils vont aller se fixer sur les gènes impliqués dans la lutte contre les pathogènes.  
 
Le mode d'action, c'est que chaque facteur de transcription va reconnaitre une séquence particulière dite canonique. Si la séquence en amont du gène correspond exactement la séquence canonique, le facteur de transcription va se lier fortement, il recrutera à son tour efficacement la RNA pol II et on aura une forte transcription. Si la séquence n'est pas exacte (un nombre limité de mutations par rapport à la séquence canonique), le facteur de transcription se liera moins efficacement et la transcription sera plus faible. Et pour finir, si il n'y a rien qui ressembme de près ou de loin à cette séquence canonique, CE facteur de transcription ne sera pas capable de transcrire CE gène.
 
En amont de chaque gène tu auras donc des éléments correspondant à un (ou plusieurs) facteurs de transcriptions et décrivant pour chacun d'entre eux à quel niveau le gène doit être transcrit.

n°47273532
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 03-10-2016 à 19:27:51  profilanswer
 

Oki mici les gens, ça montre bien que j'ai encore plein de choses à apprendre  :D

 

Enfin je me plains pas, c'est fascinant comme sujet (pour le moment  :o )


Message édité par bomberm4n le 03-10-2016 à 19:28:46

---------------
graaah !
n°47291416
Rasthor
Posté le 05-10-2016 à 11:48:59  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


 
Ca me semble un peu tot, non ? :??:


J'avais raison !   [:haha jap]

n°47293333
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 05-10-2016 à 14:19:16  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


J'avais raison !   [:haha jap]


 
On aura raison l'année prochaine, c'est pas grave  [:c4nuser]

n°47294041
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 05-10-2016 à 15:06:47  profilanswer
 

Un français Nobel de Chimie !!!
 
http://i.giphy.com/yoJC2GnSClbPOkV0eA.gif

n°47387291
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 14-10-2016 à 09:22:45  profilanswer
 

Salut les lapins, nouvelle question encore :o

 

Lors de la réplication, il devient quoi le primer du leading strand (pourquoi on parle que du lagging strand pour le raccourcissement des télomères en gros) ?

 

Thx  :p

Message cité 1 fois
Message édité par bomberm4n le 14-10-2016 à 09:23:01

---------------
graaah !
n°47389050
Aragorn Le​ Rouge
Posté le 14-10-2016 à 11:15:45  profilanswer
 

bomberm4n a écrit :

Salut les lapins, nouvelle question encore :o
 
Lors de la réplication, il devient quoi le primer du leading strand (pourquoi on parle que du lagging strand pour le raccourcissement des télomères en gros) ?  
 
Thx  :p


 
Parce que l'origine de réplication ne commence pas en bout de chromosome. Donc il y aura réplication même au niveau du primer du leading avec l'avancement de la fourche. Par contre pour le lagging, arrivé au bout, bah c'est le bout donc quand le primer se barre, c'est raccourci, sauf si intervention d'une télomerase pour éviter la perte d'info.


---------------
@avd.racing The margin between success and drama is fractional. - Jacky Ickx
n°47391131
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 14-10-2016 à 13:59:59  profilanswer
 

Je suis sans doute resté fixé sur une seule fourche en oubliant qu'il y a des "bulles" avec des fourches des 2 côtés.

 

C'est image est correcte alors ? Les leading et lagging strands ne sont pas absolus mais relatifs au côté de la bulle qu'on considère ?
http://images.slideplayer.com/13/4023241/slides/slide_51.jpg

 

Message cité 1 fois
Message édité par bomberm4n le 14-10-2016 à 14:00:16

---------------
graaah !
n°47391329
epsiloneri​dani
Modérateur
Posté le 14-10-2016 à 14:13:30  profilanswer
 

bomberm4n a écrit :

Je suis sans doute resté fixé sur une seule fourche en oubliant qu'il y a des "bulles" avec des fourches des 2 côtés.
 
C'est image est correcte alors ? Les leading et lagging strands ne sont pas absolus mais relatifs au côté de la bulle qu'on considère ?
http://images.slideplayer.com/13/4 [...] ide_51.jpg
 


 
Oui, "lagging" et "leading" c'est toujours relatif à une fourche, pas par rapport à l'ensemble d'un chromosome. Un même brin peut donc être "leading" à un endroit et "lagging" un peu plus loin :jap:  
 

n°47391498
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 14-10-2016 à 14:23:51  profilanswer
 

Chouette ça me débloque, c'est tout con quand on y pense mais j'ai pas saisi tout de suite [:kwak]


---------------
graaah !
n°47396332
Aragorn Le​ Rouge
Posté le 14-10-2016 à 20:58:19  profilanswer
 

Quand c'est comme ça cherche des animations ça aide à piger la "mécanique" ;)


---------------
@avd.racing The margin between success and drama is fractional. - Jacky Ickx
n°47397200
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 14-10-2016 à 21:52:32  profilanswer
 

C'est comme ça que je suis tombé sur l'image précédente, malheureusement pour la majorité des trucs on ne s'intéressait qu'à une fourche sans considérer l'autre côté :(


---------------
graaah !
n°47451491
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 20-10-2016 à 07:46:53  profilanswer
 

C'est encore moi :o
 
Dites, ça vient d'où les plasmides ?  
 
Ce sont des reliquats d'un organisme primitif ? Un truc qui s'est formé par hasard dans certaines cellules et qui est resté ?


---------------
graaah !
n°47462358
Oceanborn
Posté le 20-10-2016 à 23:54:16  profilanswer
 

Ca devait conférer un avantage évolutif chez les cellules primitives dans le transfert de gène? J'en sais rien en fait. :o
Quelqu'un a posé la question sur Reddit : https://www.reddit.com/r/askscience [...] hey_there/ , les réponses sont pas fameuses non plus. :o
 
 
Bon, entretien mardi pour mon stage de M2 avec le chef d'un labo au Genome Institute of Singapore.  [:minipinguin]  
C'est pas mal comme destination, surtout qu'ils bossent sur des trucs super intéressants.
Et j'ai aussi potentiellement un stage dans une énorme biotech de SF, mais c'est pas sûr ça. Si j'ai le choix ça sera dur de décider. :o

Message cité 1 fois
Message édité par Oceanborn le 20-10-2016 à 23:54:52
n°47463863
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 21-10-2016 à 09:57:37  profilanswer
 

Ah bah pour la qualité de vie y'a pas photo.
Singapoure c'est une cité fasciste ultra-autoritaire et SF c'est le centre du monde libre   :o  
 
Je rigole qu'à moitié  [:cosmoschtroumpf]


Message édité par RykM le 21-10-2016 à 09:57:50
n°47464629
the veggie​ boy
Mammy
Posté le 21-10-2016 à 10:53:14  profilanswer
 

faut vouloir vivre entouré de tech-bros (et avoir le salaire kivabien) pour supporter SF :o


---------------
blacklist
n°47464827
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 21-10-2016 à 11:07:38  profilanswer
 

the veggie boy a écrit :

faut vouloir vivre entouré de tech-bros (et avoir le salaire kivabien) pour supporter SF :o


 
SF ça se réduit pas à la silicon valley  [:cosmoschtroumpf]

n°47474245
bomberm4n
grumpf ?
Posté le 22-10-2016 à 06:43:14  profilanswer
 

Bon, je vous embête encore avec une question mais c'est parce que je vous aime :o

 

Pour séquencer un génome avec la méthode de Sanger, on le coupe en petits bouts parce qu'on ne sait pas lire des fragments trop longs. Pour le séquençage en tant que tel
on utilise tout plein de clones d'un même fragment avant de réassembler le tout. En espérant avoir été correct, comment est-ce qu'on a isolé les fragments originels (avant de les cloner) ou les clones pour les séquencer ?

Message cité 1 fois
Message édité par bomberm4n le 22-10-2016 à 06:45:03

---------------
graaah !
n°47479905
Ayrin
Miaou
Posté le 23-10-2016 à 01:36:55  profilanswer
 

Oceanborn a écrit :


Bon, entretien mardi pour mon stage de M2 avec le chef d'un labo au Genome Institute of Singapore.  [:minipinguin]  
C'est pas mal comme destination, surtout qu'ils bossent sur des trucs super intéressants.
Et j'ai aussi potentiellement un stage dans une énorme biotech de SF, mais c'est pas sûr ça. Si j'ai le choix ça sera dur de décider. :o


 
T'as entretien quand pour SF ? Savoir quand tu vas devoir faire ton choix entre les deux. Joli en tout cas  [:implosion du tibia]

mood
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