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J'ai eu le même problème en mode bi-écran.
Un écran LCD en VGA analogique et l'autre LCD en DVI.
L'analogique s'allume dès le début alors que le DVI ne s'allume qu'à l'écran d'accueil de Windows.
SI vous avez une carte graphique ATI, branchée par exemple également avec un cable S-VHS sur une TV, c'est parfaitement normal, car au départ elle initialise le port DVI en 50Hz, fréquence non supportée par de nombreux moniteurs LCD.
Il y a un paramètre à changer sur la carte, je ne sais plus s'il faut déplacer un cavalier ou flasher le BIOS, mais c'ets vrai que c'est galère.
Enfin moi je m'en fous, comme j'ai deux écran, si je veux accéder au BIOS il s'affiche sur l'écran VGA, nickel.